截至2016年8月，學校現有78個本科專業，其中包括：
1、重點學科：草業科學；
2、國家重點學科：農業水土工程、動物遺傳育種與繁殖、水土保持與荒漠化防治；
3、國家林業局重點學科：木材科學與技術、森林培育、水土保持與荒漠化防治；
4、內蒙古自治區重點一級學科：農業工程、作物學、畜牧學、獸醫學、林學；
5、內蒙古自治區重點學科：農業機械化工程、農業水土工程、動物遺傳育種與繁殖、動物營養與飼料科學、草業科學、基礎獸醫學、森林培育、水土保持與荒漠化防治、農業電氣化與自動化、作物栽培學與耕作學、作物遺傳育種、預防獸醫學、臨床獸醫學、森林保護學、森林經理學、生物化學與分子生物學、水文學及水資源、木材科學與技術、農產品加工及貯藏工程、果樹學、蔬菜學、農業經濟管理；
6、內蒙古自治區重點培育學科：農業昆蟲與害蟲防治、水工結構工程、野生動植物保護與利用、園林植物與觀賞園藝。
其專業分別有：哲學、經濟學類、法學、教育技術學、漢語言文學、英語、歷史學、數學與應用數學、資訊與計算科學、應用化學、生物科學、生物技術、生態學、生物科學類、統計學、機械類、機械設計製造及其自動化、工業設計、材料科學與工程、材料化學、能源與環境系統工程、電子資訊類、光電資訊科學與工程、電子資訊科學與技術、計算機科學與技術、軟體工程、網路工程、土木工程、水利水電工程、測繪工程、製藥工程、服裝設計與工程、包裝工程、農業機械化及其自動化、木材科學與工程、環境工程、環境科學、資源環境科學、食品科學與工程、食品質量與安全、建築學、生物工程、農學、園藝、植物保護、種子科學與工程、設施農業科學與工程、茶學、動物科學、蠶學、動物醫學、動物藥學、林學、園林、水產養殖學、草業科學、資訊管理與資訊系統、工商管理類、農林經濟管理、公共管理類、工業工程、旅遊管理。
農業大學的專業有以下幾種：
社會學、數學與應用數學、法學、英語、經濟學類、生物工程、葡萄與葡萄酒工程、食品質量與安全、食品科學與工程、環境科學與工程類、農業工程類、水利類、土木類、計算機科學與技術、電子資訊類、電氣工程及其自動化、車輛工程、工業設計、機械電子工程、機械設計造及其自動化、工程力學、公共事業管理、農村區域發展、市場營銷、工商管理、工商管理類、理科試驗班類、理科試驗班、經濟學類（中外合作辦學）、生物科學類、化學類、草業科學、水產養殖學、園林、動物醫學、動物科學、設施農業科學與工程、植物生產類、傳播學。