1、北京大學包含北京大學醫學部。北京大學醫學部為北京大學六大學部之一，但其他學部為虛設，醫學部具有實體的行政體系。通常說的北大，特指北京大學校本部（燕園校區）。
2、按照官方說法，北大、北醫同根同源。但是畢竟經歷了大半個世紀的獨立運營，都有很高的知名度。整個北醫系統，包括醫院實力、聲望和校友資源都達到了極高的影響力，因而在與北大合併的時候底氣十足。經過各種博弈妥協，最終以醫學部的形式與本部合併，保留了醫學部行政體系的獨立，因而合併前與合併後平滑過渡。
3、招生：除了2000年合併首年外，其他年份醫學部和本部採用兩套招生程式碼，很容易讓人感覺北大和北醫是兩個獨立的院校。
1、基礎醫學和臨床醫學的側重點不同,一個是研究基礎學科如解剖、生理、生化、微生物等等學術性內容,臨床醫學是以內外婦兒、五官科、眼科、皮膚科等等臨床應用學科的內容。
2、學習的課程涵蓋幾乎所有的醫學課程,就是兩個醫學專業都需要學習基礎+臨床課程,只是重點側向部分課程。臨床醫學專業還有一年的臨床實習期，這是基礎醫學沒有的。
基礎醫學和臨床醫學的區別是：基礎醫學研究醫學基礎，比如解剖、生理、生化、微生物等等，臨床醫學就是我們去醫院看見的那些門診，內外科、五官科、眼科、皮膚科等等，其實兩個專業都有臨床的可能，但是臨床專業的臨床時間更長，因為他們還有一年起步的臨床實習期。
基礎醫學和臨床醫學專業大方向不同：
基礎醫學更加偏理論，臨床醫學更偏實踐，學習基礎醫學也有實踐，但一般都是實驗課，臨床醫學則是直接面對病人，需要面對各種突發情況，解決當下發生的事情。而基礎醫學的方向是深究某個理論，走在臨床/實踐醫學的前面。
基礎醫學和臨床醫學就業方向不同：
基礎醫學畢業以後在研究所工作，或者是生物技術公司、醫療工作，從事研發之類的工作。
而臨床醫學一般都在前線，可以當醫生、也可以從事麻醉學、放射科、等等崗位。在醫院工作需要考執業醫師整，而基礎醫學專業是不能考這個證的。
1、基礎醫學(英語縮寫BMS)，屬於基礎學科，是現代醫學的基礎。基礎醫學是研究人的生命和疾病現象的本質及其規律的自然科學。其所研究的關於人體的健康與疾病的本質及其規律為其他所有應用醫學所遵循。
基礎醫學專業培養具備自然科學、生命科學和醫學科學基本理論知識和實驗技能，基礎醫學畢業能夠在高等醫學院校和醫學科研機構等部門從事基礎醫學各學科的教學、科學研究及基礎與臨床相結合的醫學實驗研究工作的醫學高階專門人才。
2、臨床醫學是研究疾病的病因、診斷、治療和預後，提高臨床治療水平，促進人體健康的科學。
臨床即“親臨病床”之意，臨床醫學是研究疾病的病因、診斷、治療和預後，提高臨床治療水平，促進人體健康的科學。它根據病人的臨床表現，從整體出發結合研究疾病的病因、發病機理和病理過程，進而確定診斷，透過預防和治療以最大程度上減弱疾病、減輕病人痛苦、恢復病人健康、保護勞動力。臨床醫學是直接面對疾病、病人，對病人直接實施治療的科學。