有日語專業、電氣資訊類專業、應用物理學專業、應用化學專業、英語專業、資訊與計算科學專業、會計學專、材料物理專業、環境科學專業、地理資訊系統專業、電氣工程及其自動化專業、應用氣象學專業、軟體工程專業、物流管理專業、電子科學與技術專業、數學與應用數學專業、電子資訊工程專業、計算機科學與技術專、資源環境與城鄉規劃管理專業、法學專業、網路工程專業、公共事業管理專業、測繪工程專業、生態學專業、財務管理專業、對外漢語專業、通訊工程專業、大氣科學專業、統計學專業、自動化專業、國際經濟與貿易專業、雷電防護科學與技術專業、資源環境與城市規劃管理專業、海洋科學專業、市場營銷專業、物理學專業、農業資源與環境專業、環境工程專業、漢語言文學專、資訊工程專業、人力資源管理專業、電氣工程與自動化專業、遙感科學與技術專業、光資訊科學與技術專業、行政管理專業、資訊管理與資訊系統專業、測控技術與儀器專業。
截止2018年三月，南京資訊工程大學有45個社團分別是校園音樂協會、GBFIVE舞協、火柴盒劇社拍吧、書畫攝影協會、天然動漫社、戲曲協會、新絲雨模特協會、新影社、星之夢舞蹈協會、特別靈魂團體SSC、吉他協會、籃球愛好者協會、敏思口才協會、排球愛好者協會、棋牌協會、散打協會、跆拳道部、檯球協會、網球協會、羽毛球愛好者協會、風行輪滑社、瑜珈協會、腳踏車愛好者協會、足球愛好者協會、武術協會、電子競技協會、旅遊愛好者協會、乒乓球競技協會、科研學術類、天文愛好者協會、氣象科技協會、蔚藍海洋協會、英語俱樂部、日語學習社、山南文學社、瘋狂英語社、韓國語言文化交流社、粵語文化交流社、格致青年會、校園誦讀協會、社會實踐類、創業者聯盟、未來企業家協會、GO實踐社、投資與理財交流協會。
1、林學院：林學，水土保持與生態工程，森林保護，園藝，地理資訊科學，生物技術；
2、化學工程學院：化學工程與工藝，林產化工，生物工程，生物製藥；
3、機械電子工程學院：機械設計製造及其自動化，機械電子工程，自動化，測控技術與儀器，過程裝備與控制工程；
4、材料科學與工程學院：林材科學與工程，木結構建築，材料科學與工程，能源與動力工程，新能源科學與工程，包裝工程；
5、經濟管理學院：農林經濟管理，工商管理，會計學，會計學cima班，市場營銷，國際經濟與貿易，法學，資訊管理與資訊系統，電子商務，金融工程；
6、土木工程學院：森林工程，土木工程交通土建，土木工程建築工程，給排水科學與工程，工程管理，測繪工程；
7、人文社會科學學院：漢語言文學，漢語國際教育，廣告學，旅遊管理，社會工作，廣播電視學等。