1、堆藏，堆藏是把選好的南瓜直接堆放在室內。堆放前地面先鋪一層乾草或麥秸，上面堆放南瓜。擺放的方向和生長時的狀態相同，可將瓜蒂朝裡，瓜頂朝外，依次堆碼成圓堆，每堆15-25個，高度5-6個瓜高為好。同時留出通道，以便檢查。
2、窖藏，窖藏的南瓜宜選用主蔓上第二個瓜，根瓜不宜作貯藏用。生育期間最好不使瓜直接著地，並要防止陽光暴曬。採收時謹防機械損傷，特別要禁止滾動、拋擲，否則內瓤震動受傷易導致腐爛。南瓜採收後宜在24℃-27℃下放置2周，使瓜皮硬化有利於貯藏，這對成熟度較差的瓜尤為重要。
3、架藏，架藏的倉位選擇、質量挑選、降溫、防寒和通風等要求與堆藏相同。所不同的是倉庫內用木、竹或角鐵搭成分層貯藏架，鋪上草包，將瓜堆放在架上。或用板條箱墊一層麥秸作為容器。瓜放入後碼成垛進行貯藏。這種方法透風散熱效果比堆藏好，倉位容量也比堆藏大，觀測、檢查比較方便。
1、貯藏南瓜的選擇：
需要貯藏的南瓜必須是老熟瓜。老熟南瓜的果皮硬，呈現固有的色澤，果面蠟粉較多，有利於儲存。上午陰涼時採收為宜，採收時將瓜柄上5～10釐米的一段蔓剪下，保留一段果梗。貯藏的瓜不能遭霜打，在生長期間應在瓜下墊磚或吊空，並防止日光暴曬。貯藏前，剔除損傷瓜、未成熟瓜、爛秧的瓜、病蟲為害的瓜等，只保留無病蟲害、無損傷的活藤瓜，這樣可以貯藏2個月以上。
2、南瓜貯藏條件：
南瓜貯藏場所應選通風、陰涼的庫房，地面放木板，單層碼放，或搭架分層存放，防止潮溼。貯藏的適溫在10℃左右，空氣相對溼度為70%～75%。可以貯存在空屋內或溼度較低的窖內，地面鋪細沙、麥稈或稻草，堆放2～3層瓜。
1、堆藏
堆藏首先我們要選擇健康無傷口的優質南瓜，然後直接將其堆放在室內。在堆放之前，要在室內的地面上鋪放一層乾草秸稈，然後再在上面堆放南瓜。堆放時，要注意南瓜的方向應與生長狀態一致，讓瓜蒂朝內，瓜頂朝外。再一次堆成圓堆。每堆數量保持在20個左右，高度為5個左右。要注意保留供人行走的通道，便於檢視。貯藏時，如果溫度較高的話，那麼晚上要做好通風工作。白天避免太陽直射，保持室內空氣乾燥新鮮。
2、窖藏
窖藏也是南瓜常用的一種貯藏方法，不過窖藏對南瓜的選擇是非常重要的。應選擇主蔓上的第二個瓜，如果是根瓜的話，那麼是不宜選擇窖藏為主要貯藏方法的。在南瓜的生育期間時，儘量不要讓南瓜接觸地面，也要避免陽光直射。在採收的時候要注意力度，避免瓜出現機械損傷，不可滾動拋擲等。如果內瓤震動的話，極易導致瓜腐爛。在採收後，應將瓜放在25度左右的溫度下半個月左右。讓南瓜表皮硬化，可提高瓜的貯藏能力。
3、架藏
在對南瓜進行架藏時，首先要選好倉位、瓜等。其質量、溫度以及通風等應與堆藏標準保持一致。不過我們應在倉庫內同木竹等物質搭建好分層的貯藏架，然後在架子上鋪好草包，再將瓜堆放在架子上。或者也可以用板條箱，在箱底鋪一層秸稈，然後將瓜碼成垛之後進行貯藏。架藏的通風散熱能力是比較強的，貯藏量也比較大，便於檢查。