二者各有千秋，在理工類專業吉林大學較強，在經濟金融類專業上海財經大學較好。
上海財經大學是中華人民共和國教育部直屬的一所以經濟管理學科為主，經、管、法、文、理、哲等多學科協調發展的研究型重點大學；是國家“211工程”、“985工程優勢學科創新平臺”重點建設高校，國家“雙一流”世界一流學科建設高校；吉林大學是中華人民共和國教育部直屬的綜合性全國重點大學，國家“雙一流”、“211工程”、“985工程”、“2011計劃”重點建設的著名學府。
二者各有千秋，在理工類專業吉林大學較強，在經濟金融類專業上海財經大學較好。
上海財經大學是中華人民共和國教育部直屬的一所以經濟管理學科為主，經、管、法、文、理、哲等多學科協調發展的研究型重點大學；是國家“211工程”、“985工程優勢學科創新平臺”重點建設高校，國家“雙一流”世界一流學科建設高校；吉林大學是中華人民共和國教育部直屬的綜合性全國重點大學，國家“雙一流”、“211工程”、“985工程”、“2011計劃”重點建設的著名學府。
兩者各有所長。
南京大學：簡稱南大，是中華人民共和國教育部直屬、中央直管副部級建制的全國重點大學，國家首批雙一流、211工程、985工程重點建設高校，入選首批珠峰計劃、111計劃、2011計劃、卓越工程師教育培養計劃、卓越醫生教育培養計劃、卓越法律人才教育培養計劃，九校聯盟、中國大學校長聯誼會、環太平洋大學聯盟、21世紀學術聯盟和東亞研究型大學協會成員。
上海財經大學：簡稱上海財大，是中華人民共和國教育部直屬的一所以經濟管理學科為主，經、管、法、文、理、哲等多學科協調發展的研究型重點大學；是國家211工程、985工程優勢學科創新平臺重點建設高校，國家雙一流、世界一流學科建設高校；入選國家經濟學基礎人才培養基地、國家海外高層人才創新創業基地、教育部人文社會科學重點研究基地、卓越法律人才教育培養計劃。由教育部、財政部和上海市人民政府三方共建。
上海財經大學不是985，是211。是中華人民共和國教育部直屬的一所以經濟管理學科為主，經、管、法、文、理、哲等多學科協調發展的研究型重點大學，由教育部、財政部和上海市人民政府三方共建。
上海財經大學是國家“211工程”、“985工程優勢學科創新平臺”重點建設高校，國家“雙一流”世界一流學科建設高校；入選“國家經濟學基礎人才培養基地”、“國家海外高層人才創新創業基地”、“教育部人文社會科學重點研究基地”、“卓越法律人才教育培養計劃”、“國家建設高水平大學公派研究生專案”、“中國政府獎學金來華留學生接收院校”、“海外高層次人才引進計劃”、“111計劃”；是全國首批博士、碩士、學士學位授予單位之一。
在國家重點學科上，上海財經大學有4個國家重點學科（含1個培育學科），在雙一流建設中，上海財經大學的統計學入選雙一流學科。在人才配置上，上海財經大學有千人計劃入選者10人，“長江學者”9人。
根據教育部第四輪學科評估，上海財經大學有3個學科入選A類，其中2個學科入選A，一個學科入選A-。