1、江戶川柯南：本故事的主人公。真實身份為高中生偵探工藤新一，由於被黑衣組織的成員灌下毒藥APTX4869而導致身體變小，之後化名為“江戶川柯南”，為了調查黑衣組織而寄住在毛利偵探事務所。就讀於帝丹小學一年級B班，是少年偵探團成員。
2、工藤新一：17歲，帝丹高中二年級B班學生，高中生偵探，被稱為“平成年代的福爾摩斯”、“日本警察的救世主”，很多案件在他的活躍之下得以偵破。後來被黑衣組織灌下毒藥，身體變小。
3、毛利蘭：16歲，本故事的女主角。帝丹高中二年級B班學生，毛利小五郎的女兒，帝丹高中空手道社的主將。毛利偵探事務所的女主人，新一青梅竹馬的女友。將柯南像弟弟一樣對待。
1、工藤有希子。曾經有網友特地去統計過，在名偵探柯南的世界裡，誰到底是最漂亮的。但是結果很明顯的是，工藤有希子獲得了第一名。而我們在劇中第一次見到工藤有希子的時候，真的被她驚豔到了。雖然他已經是一名高中生的母親，但是卻經常喜歡，搞怪扮可愛，但是這些在她身上卻並沒有覺得不適，反而為她增添了一些另類的魅力。
2、貝爾摩德。她是工藤有希子的閨蜜，也是黑衣組織中的一員。但是，知道柯南真實身份的她，卻從來都沒有傷害過柯南。她的長相是偏向於成熟性感型別，對於像這種人，相信是有非常多的網友喜歡他這種型別的，畢竟成熟性感永遠是秒殺是為男性的最佳方法。至於智商方面，完全可以在劇中排名第一。
3、妃英里。她是女主毛利蘭的媽媽，在一開始的時候，她給人一種非常嚴肅的感覺。剛第一眼望去，就認為她絕對是一個女強人。渾身充滿了幹勁，也是律師界的不敗女王。不過非常可惜的是，她溫柔一面，也只有在毛利小五郎面前才會展現出來。雖然他和毛利小五郎離婚了，但是兩人但內心卻依然愛著對方，只不過兩人一見面就吵，完全無法溝通，讓小蘭操碎了心。
4、毛利蘭。她作為女主，顏值方面當然不可能會低，如果不是上面三位，都擁有自己獨特的魅力，顏值排行榜第一名的位置絕對是毛利蘭的。畢竟從毛利蘭生活的表現來看，絕對是一個完美的女朋友，出得了廳堂，下得了廚房，甚至在遇到危險的時候，還可以反過來保護男朋友。相信像這樣的女朋友，絕對是所有人夢寐以求的吧。
5、灰原哀。別看他現在只是一副小女孩的樣子，但就只是這樣子，回來就已經吸引了很大一部分的粉絲。甚至有很多人，認為灰原哀和江戶川柯南才是最配的，也許在未來，可能永遠也無法變回工藤新一，這樣他也就只能選擇和灰原哀在一起了。畢竟兩人都是從成人變回小孩子，再從小孩子慢慢成長為成人，這其中的感情絕對不是一般的感情能比擬的。
6、佐藤美和子。她被稱為警視廳之花，公認的最美警官，受到非常多的男性警官的愛慕。為人也非常的講義氣，嫉惡如仇，在抓壞人的時候不是為任何一位男警官。不過在有的時候，她也會變得非常溫柔，比如在遇到高木警官的時候。在此之前，可是有很多人在追求佐藤美和子，但是最終卻是高木警官得到了佐藤美和子的芳心，這也算是一個美好的結局。
名偵探柯南黑衣組織的主要成員有貝爾摩德、基爾、安室透等。
1、貝爾摩德。黑衣組織重要成員，真實身份是美國女明星莎朗·溫亞德。因某種原因恢復年輕或停止衰老。擅長易容術與變聲術，各方面能力出眾。在組織中負責收集重要的情報，經常單獨行動，被稱為“神秘主義者”。
2、基爾。真名本堂瑛海，本堂瑛佑的姐姐。真實身份是CIA派入黑衣組織進行臥底調查的諜報員，組織代號基爾。
3、安室透。真實身份為日本公安警察派入黑衣組織的臥底 ，組織代號"波本"。表面職業為私家偵探、餐廳服務生，擅長蒐集情報，有極強的觀察力與推理能力。