顯微鏡的使用方法如下：
1、一隻手握住鏡臂，另一隻手託著鏡座，將顯微鏡向著光擺放在平坦的桌面上；
2、轉動轉換器，將低倍物鏡轉到鏡筒下；
3、調節載物臺下的反光鏡，從目鏡往下看，能看見一個亮的光圈；
4、調節粗準焦螺旋將鏡筒抬起，使低倍物鏡離載物臺大約2-3釐米。將想觀察的標本的載玻片放在載物臺上，用壓片夾夾住，要使標本恰好在載物臺通光孔的中央；
5、調節準焦螺旋，降低鏡筒，使低倍物鏡恰好在載玻片的上面；
6、從目鏡往下看，調整
顯微鏡的使用方法如下：
1、一隻手握住鏡臂，另一隻手託著鏡座，將顯微鏡向著光擺放在平坦的桌面上；
2、轉動轉換器，將低倍物鏡轉到鏡筒下；
3、調節載物臺下的反光鏡，從目鏡往下看，能看見一個亮的光圈；
4、調節粗準焦螺旋將鏡筒抬起，使低倍物鏡離載物臺大約2-3釐米。將想觀察的標本的載玻片放在載物臺上，用壓片夾夾住，要使標本恰好在載物臺通光孔的中央；
5、調節準焦螺旋，降低鏡筒，使低倍物鏡恰好在載玻片的上面；
6、從目鏡往下看，調整
1、正確對光的問題
對光是使用顯微鏡時很重要的一步，有些學生在對光時，隨便轉一個物鏡對著通光孔，而不是按要求一定用低倍鏡對光。轉動反光鏡時喜歡用一隻手，往往將反光鏡扳了下來。所以教師在指導學生時，一定要強呼叫低倍鏡對光，當光線較強時用小光圈，平面鏡，而光線較弱時則用大光圈，凹面鏡，反光鏡要用雙手轉動，當看到均勻光亮的圓形視野為止。光對好後不要隨便的移動顯微鏡，以免光線不能準確的透過反光鏡進入通光孔。
2、正確使用準焦螺旋的問題
使用準焦螺旋調節焦距，找到物象可以說是顯微鏡使用中最重要的一步，也是學生感覺最為困難的一步。 學生在操作中極易出現以下錯誤：一是在高倍鏡下直接調焦 ; 二是不管鏡筒上升或下降，眼睛始終在目鏡中看視野；三是不瞭解物距的臨界值，物距調到 2 ～ 3 釐米時還在往上調，而且轉動準焦螺旋的速度很快。前兩種錯誤結果往往造成物鏡鏡頭牴觸到裝片，損傷裝片或鏡頭，而第三種錯誤則是學生使用顯微鏡時最常見的一種現象。針對以上錯誤，教師一定要向學生強調，調節焦距一定要在低倍鏡下調，先轉動粗準焦螺旋，使鏡筒慢慢下降，物鏡靠近載玻片，但注意不要讓物鏡碰到載玻片，在這個過程中眼睛要從側面看物鏡，然後用左眼朝目鏡內注視，並慢慢反向調節粗準焦螺旋，使鏡筒緩緩上升，直到看到物像為止，同時向學生說明一般顯微鏡的物距在 1 釐米 左右，所以如果物距已遠遠超過 1 釐米 ，但仍未看到物象，那可能是標本未在視野內或轉動粗準焦螺旋過快，此時應調整裝片位置，然後再重複上述步驟，當視野中出現模糊的物象時，就要換用細準焦螺旋調節，只有這樣，才能縮小尋找範圍，提高找到物象的速度。
3、物鏡轉換的問題
使用低倍鏡後換用高倍鏡，學生往往喜歡用手指直接推轉物鏡，認為這樣比較省力，但這樣容易使物鏡的光軸發生偏斜，原因是轉換器的材料質地較軟，精度較高，螺紋受力不均勻很容易鬆脫。一旦螺紋破壞，整個轉換器就會報廢。教師應指導學生手握轉換器的下層轉動扳轉換物鏡。
五、光學玻璃清洗的問題
光學玻璃用於儀器的鏡頭、稜鏡、鏡片等。 在製造和使用中容易沾上油汙、水溼性汙物、指紋等，影響成像及透光率。清洗光學玻璃，應根據汙垢的特點、不同結構，選用不同的清洗劑，使用不同的清洗工具，選用不同的清洗方法。清洗鍍有增透膜的鏡頭，如照相機、幻燈機、顯微鏡的鏡頭，可用 20% 左右的酒精和 80% 左右的乙醚配置清洗劑進行清洗。清洗時應用軟毛刷或棉球沾有少量清洗劑，從鏡頭中心向外做圓運動。切忌把這類鏡頭浸泡在清洗劑中清洗，清洗鏡頭時不要用力擦拭，否則會損傷增透膜，損壞鏡頭。
1、將低倍鏡轉至鏡筒下方與鏡筒成一直線。
2、撥動反光鏡，調節至視野最亮無陰影。反光鏡有平、凹兩面，光源強時用平面，較暗時用凹面，需要強光時，將聚光器提高，光圈放大；需要弱光時，將聚光器降低，或光圈適當縮小。
3、將待觀察的標本置載物臺上，轉動粗調節器使鏡筒下降至接物鏡接近標本。於轉動粗調節器的同時，須俯身在鏡旁仔細觀察接物鏡與標本之間的距離。
4、左眼於接目鏡觀察，同時左手轉動粗調節，使鏡筒徐徐上升以調節焦距，使視野內的物象看到上時即停，至標本清晰為止。