1、本作的主人公詹姆士（James）某天突然收到一封神秘信件，署名竟然是3年前已故的愛妻瑪麗（Mary），信中叫他去寂靜嶺曾經屬於他們倆的特殊地方（Special Place）。滿懷期望和疑惑的詹姆士駕車來到寂靜嶺，希望能找到事情的真相。此時的寂靜嶺已經被大霧所包圍，怪物的出現和潛意識裡片段記憶的浮現更是讓詹姆士的內心不安。歷經幾翻周折後，詹姆士終於來到了妻子在信中提到的“Special Place”所在地-----Toluca湖畔Lakeview Hotel的302室，這裡也是他們新婚蜜月旅行時住的地方。
2、在這裡，他從一盤錄影帶中看到的影象，將他來到寂靜嶺之後所甦醒的潛意識裡的片段記憶串聯起來，原來3年前身患絕症妻子瑪麗並沒有馬上死去，而是自己內心認定妻子已經死了，並且強迫性的忘卻妻子的死因。而現在他全都記起來了。詹姆士也是因為潛意識中的“犯罪感”，來到了寂靜嶺。由於當時妻子病倒在床上，詹姆士天天去醫院照顧她，但妻子的病情逐漸惡化，情緒也變的很暴躁，經常指責詹姆士。
3、開始的時候，詹姆士因為深愛著妻子，所以處處忍讓，長期下來他的精神陷入了極度壓抑之中，加上住院期間醫藥費造成的承重的經濟負擔，詹姆士再也忍受不了這種精神上的折磨，看著被病魔折磨的面容枯槁的妻子，他認為妻子的死只是時間的問題，於是產生了讓妻子安樂死的念頭。這樣可以結束彼此的痛苦和折磨。但他怎麼也不忍心殺害自己一直深愛的妻子。徘徊在道德和現實的矛盾之間，詹姆士最終選擇了離棄妻子，因為不想受到良心上的譴責，就強迫自己忘卻這段記憶，內心也認定妻子已經死亡。
4、此時身處醫院的瑪麗內心也很矛盾，她不想再這樣拖累丈夫，想一死了之，但是又渴望得到丈夫的呵護。詹姆士走後，她天天都在病床上期盼著能再見到詹姆士，可惜他再也沒有出現。病入膏肓的瑪麗臨死前留下了兩封信。一封是給詹姆士的，希望他明白自己的心意；另一封是給病中好友勞拉的，希望她不要過多的指責詹姆士。詹姆士認為是自己在妻子最需要他的時候而離棄妻子，是自己對妻子的不忠才導致妻子死亡的，從而潛意識裡不斷的自責，“罪惡感”也隨即產生。
5、遊戲中詹姆士遇到瑪麗亞（Maria），一個長相酷似妻子的女子，但她一身耀眼的紅色裝扮和性感開放的個性，加上富有挑逗性的語言和動作，都和妻子形成鮮明的對比。這也是詹姆士潛意識中所需要的完美妻子的形態。而一直追殺瑪麗亞和自己的三角頭怪物（Pyramid Head），也是詹姆士潛意識中“犯罪感”的一種體現，所以他也一直殺不死這個怪物。每次三角頭怪物出現都在做跟性有關的事情：強姦或性虐待。這是由於妻子從生病一直到現在，詹姆士都是過著單身生活，作為正常男人生理上必然會產生了性壓抑和性幻想。攻擊詹姆士，是因為他一直想懲罰自己的潛意識；而攻擊瑪麗亞，是因為他一直認為是自己害死的瑪麗。
6、而最後與三角頭怪物的決戰，表示詹姆士潛意識中的“犯罪感”已經逐漸在消除，他擺脫一直纏繞自己的精神束縛。除了瑪麗亞，詹姆士在寂靜嶺還遇到了勞拉（Laura），艾迪（Endy），安吉拉（Angela）。勞拉是一個年僅8歲的小女孩，天真無邪的她心中沒有任何罪惡，所以在寂靜嶺來回遊走的她，從來不受怪物的騷擾。因為曾經和瑪麗同住一間病房的時候，深受瑪麗的照顧，所以對瑪麗非常信任，也很喜歡瑪麗。但後來瑪麗病情惡化的時候，由於情緒變化很大，經常指責詹姆士，詹姆士最後離棄了瑪麗。這些都被年幼無知的勞拉看在眼裡，還一直認為是詹姆士對瑪麗不好。
7、所以，在整個遊戲裡一直和詹姆士作對，而每一次都在加深他內心的痛苦，尤其是站在牆頭說“其實你根本一點都不愛瑪麗”的一幕，更是讓詹姆士徹底的陷入自責中。而艾迪從小父母離異，沒有家庭溫暖的他，性格也變的很怪異。由於一直被別人嘲笑，內心非常自卑，長期的精神壓抑，狂怒之下將嘲笑自己的人殺死，從而內心的罪惡感也產生，在寂靜嶺一次又一次的殺人場面重演，不斷的刺激著安迪的潛意識。在內心痛苦掙扎的他，最終被詹姆士殺死，得到了應有的懲罰。