1、山東大學：
國家“211工程”、“985工程”重點建設院校。屬於“111計劃”、“珠峰計劃”、“2011計劃”、“卓越工程師教育培養計劃”、“卓越法律人才教育培養計劃”、第一批“地方立法研究服務基地”高等院校，也是重點建設的高水平大學之一；
2、廈門大學：
國家“211工程”、“985工程”重點建設高校，是國家“2011計劃”牽頭高校。入選“111計劃”、“珠峰計劃”、“卓越工程師教育培養計劃”、“卓越法律人才教育培養計劃”、“卓越醫生教育培養計劃”、國家建設
1、山東大學：
國家“211工程”、“985工程”重點建設院校。屬於“111計劃”、“珠峰計劃”、“2011計劃”、“卓越工程師教育培養計劃”、“卓越法律人才教育培養計劃”、第一批“地方立法研究服務基地”高等院校，也是重點建設的高水平大學之一；
2、廈門大學：
國家“211工程”、“985工程”重點建設高校，是國家“2011計劃”牽頭高校。入選“111計劃”、“珠峰計劃”、“卓越工程師教育培養計劃”、“卓越法律人才教育培養計劃”、“卓越醫生教育培養計劃”、國家建設
兩者各有千秋。
山東大學是一所綜合性全國重點大學。入選211、985工程。山東大學是中國近代高等教育的起源性大學。其主體是1901年創辦的山東大學堂，是繼京師大學堂之後中國創辦的第二所國立大學，也是中國第一所按章程辦學的大學；其醫學學科起源於1864年，開啟近代中國高等醫學教育之先河。
廈門大學由著名愛國華僑領袖陳嘉庚先生於1921年創辦，是中國近代教育史上第一所華僑創辦的大學，是國內最早招收研究生的大學之一，被譽為“南方之強”。學校是中華人民共和國教育部直屬的副部級大學，教育部、福建省和廈門市共建高校，是世界一流大學建設高校、國家“2011計劃”牽頭高校，入選“211工程”、“985工程”，、“111計劃”、“珠峰計劃”、“卓越工程師教育培養計劃”、“卓越法律人才教育培養計劃”、“卓越醫生教育培養計劃”、“海外高層次人才引進計劃”
1、從綜合實力來說，南京大學要比廈門大學好一些，但是從偏向經濟或是理科一類的專業來說，廈大大學會比南京大學好些；
2、南京大學是中國現代科學的發祥地之一，是哈佛大學白碧德主義影響下的中國“學衡派”的雅集地，被譽為“中國科學社的大本營和科學發展的主要基地”，是“985工程”首批九所高水平大學中唯一未合併其他院校的高校，堅持“內涵發展”，贏得社會“中國最溫和的大學”之美譽；
3、廈門大學簡稱廈大，由著名愛國華僑領袖陳嘉庚先生於1921年創辦，是中國近代教育史上第一所華僑創辦的大學，是國內最早招收研究生的大學之一，被譽為“南方之強”。學校是中華人民共和國教育部直屬的副部級大學，教育部、福建省和廈門市共建高校[2]，是世界一流大學建設高校。