一：肉眼鑑別法。肉眼法其實就是針對於水晶的顏色，透明度，光澤，色散，特殊光學效應及包裹體進行觀察。
1、看包裹體。天然水晶一般都會有絮狀物質或者針尖狀包體，而人工合成的水晶就不會有這種特徵
2、看顏色。天然水晶往往顏色不均，伴有色帶，合成水晶顏色沒有活力
3、晾感。即使在炎熱夏季的三伏天，用舌頭舔天然水晶表面，也有冷而涼爽的感覺。假的水晶，則無涼爽的感覺。
4、光照。天然水晶豎放在太陽光下，無論從哪個角度看它，都能放出美麗的光彩。假水晶則不能
5、硬度。天然水晶硬度大，用碎石在飾品上輕輕劃一下，不會留痕跡；若留有條痕，則是假水晶
6、畫線法。在紙上畫一條線，讓水晶透過直線，若有雙線出現證明是天然水晶（方法僅限於球形水晶，此原理是水晶是雙折射的寶石）
二：儀器識別法。（鑑定證書依據，此方法合理，誤差極低）
1、偏光鏡。把水晶放在偏光鏡下，旋轉360度，出現四次明亮，四次黑暗就是天然水晶
2、密度法。水晶密度是2.65克每立方厘米
3、折射率。用折射儀器測量。
1、天然水晶的溫度比較低。而人工製造的水晶溫度較高，因此，可以用手撫摸水晶，如果水晶觸手冰涼的話，則說明為天然水晶。
2、天然水晶內部會有一些絮狀。如果絮狀較大的話，就成為瑕疵了，這種水晶的價格也會低得多，但是人造水晶反而沒有棉絮。
3、一般來說水晶石越大。則說明該水晶的品質越好，因此，在購買水晶的時候，還可以從大小方面進行鑑別。
4、天然水晶的硬度較大。可以劃破玻璃，而本身則沒有什麼損傷。因此，如果水晶劃不破玻璃，反而自身會留有劃痕的話，則說明為假水晶。
5、用高倍放大鏡觀察水晶。如果能夠看到水晶內部有氣泡的話，則說明該水晶為人造水晶，反之如果沒有氣泡的話，則很可能是天然水晶。
6、把水晶放到陽光底下。然後從不同角度觀察水晶，如果水晶能夠放出光彩的話，則說明為天然水晶，反之則為人造水晶。
7、用舌頭輕輕地舔一下水晶。如果有冰涼的感覺的話，則說明為天然水晶，反之如果沒有冰涼之感的話，則說明為人工水晶。
真水晶溫度較低，用手撫摸會感到冰涼，而假水晶外表溫度較高，真水晶內部有棉絮狀的紋理，而假的內部則是透亮的。真水晶的色彩是雙晶色，顏色不均勻，假的水晶顏色均勻，而且放在太陽下還有黑點。
1、手感真的水晶它的溫度較低，可以使用手摸，如果是冰涼的就是真的水晶，如果溫度較高則是假水晶。撫摸真的水晶可以感覺到光滑感，灑上水之後水滴會迅速的滑下，而假的水晶表面則會有水的凝聚。
2、結構水晶是自然條件下形成的，所以真的水晶內部是雲霧狀、星點狀或者棉絮狀，而且還帶有裂紋。假水晶一般都是人造水晶和玻璃製作而成，內部透亮，而且真水晶的硬度要比玻璃大，真水晶可以劃破玻璃，而且不會有損傷。
3、色彩真的水晶是雙晶色，顏色一般都不均勻，而且沒有規則，在裂紋的地方也沒有顏料的堆積，放在太陽下可以放出光彩。假水晶的顏色都是透過染色和改色的，色彩一般都很鮮豔，放在太陽下不僅放不出光彩，而且還有黑點。