營養缺乏：有人觀察到，長期飢餓、手指癱瘓或固定等因素可使指甲生長緩慢。患缺鐵性貧血及造成肢端缺血的雷諾氏病，皆可引起指甲凹凸不平症。說明指甲凹凸不平與營養也有一定的關係。一般來說：此種病甲表現提示身體內鈣質、蛋白質、硫元素的缺乏，這些營養物質可以從蛋類、大蒜中取得，建議患者要經常食用為好。
天氣原因：秋天已至，天氣漸涼，而臨近冬天天氣會更加的寒冷，寒冷可使血管收縮，血流速度減慢，加重末梢組織缺氧，導致指甲凹凸不平。
真菌感染：因不注意個人衛生而引發病菌的感染也會導致指甲出現凹凸不平的情況，如果指甲的症狀除了凹陷，凹凸不平之外，還帶有變黃，增厚的情況那麼就一定是灰指甲，這就需要及時前往醫院檢查並接受治療。
首先，如果單單是不平整,可能是與缺鈣有關!如果同時紋理不清晰,而且還伴有增生等狀況就要考慮是真菌感染的可能了!指甲是一片角質結構,由多層連線牢固的角化細胞構成,細胞內充滿角蛋白絲,所以富含蛋白質和鈣的食物是保持健康,光滑,亮澤指甲的基本要素
第二，鋅,鉀和鐵以及維生素A和維生素B也對指甲的生長非常重要,因此指甲可以反映人體的營養狀況.如果維生素,鈣質等營養成分攝入不足,就會出現指甲表面不光滑,凹凸不平,沒有光澤的現象.
第三，指甲凹凸不平是因為缺鈣和鋅,平時注意飲食,也可以吃些藥品補一下,上面有黑線可以平時多吃一些含鐵和紅色的食品調理下,不是什麼大的毛病,也可以用複方酮康唑軟膏 它主治皮膚感染 外用 塗於患處 早晚一次 塗在指甲縫中 。
指甲出現凹痕表示身體內鈣質、蛋白質、硫元素的缺乏，這些營養物質可以從蛋類、大蒜中取得，經常食用為好。
指甲表面凹凸不平，沒光澤。原因是營養不足 ，(指甲是一片角質結構，由多層連線牢固的角化細胞構成，細胞內充滿角蛋白絲，所以富含蛋白質和鈣的食物是保持健康、光滑、亮澤指甲的基本要素，此外，鋅、鉀 和鐵以及維生素A和維生素B也對指甲的生長非常重要，因此指甲可以反映人體的營養狀況。如果維生素、鈣質等營養成分攝入不足，就會出現指甲表面不光滑，凹 凸不平，沒有光澤的現象。)
在臨床上，當人體的肝功能出現問題後，人們的指甲部位也會呈現出凹凸不平的情況，若是指甲容易破裂，是缺乏鐵質，應該多補充深綠色葉菜、魚類、豆類等。