醜陋的笑容
12月12日，在日本攻入南京城的前一天，炮火已經給南京的平民造成了巨大的上傷亡。12月11日，馬吉牧師用鼓樓醫院的救護車把一些傷員送到首都劇場門前的包紮中心，在他到達之前，一發炮彈落在街道上，當場炸死了11人。馬吉牧師開著救護車返回安全區時，在金陵大學附近見到幾具死於日軍炮火的中國人的屍體。他又親眼見到一發炮彈擊中一間民房，約有20人被炸死，七八個人被炸彈的氣浪拋到了街上。一對老夫妻哭得死去活來，因為他們33歲的兒子被炸死了，炮彈在他的臉上炸了一個大洞。
12月19日，星期天。馬吉牧師已經連續幾天聽到機槍作響，他估計日軍用機槍屠殺了五六千人，加上街面上被日軍隨意屠殺的中國人，總數應該超過兩萬。馬吉牧師最痛恨的是日軍強姦婦女，他寫道：“日本人以最無恥的方式幹這些勾當，街上到處是找女人的日本兵。我們存放物品的房子裡住滿了婦女，有的甚至睡到了我們的飯廳裡。她們終日惶惶不安，驚恐萬狀。前幾天，隔著一個街道的小寺院的和尚來說，日本兵帶走了兩個尼姑，他懇求我讓幾個尼姑也來躲躲，我照辦了。房子裡真是擁擠不堪。”
他還記述了週六下午，他和德國人施佩林去檢視一間屋子，看到一名婦女坐在地上哭泣，她說，她被日本並強姦了，並且告訴他們，3樓還有日本兵在強姦中國婦女。馬吉牧師當即衝上三樓，憤怒地敲門，日本兵嚇得跑出來了。
12月22日，星期三。馬吉牧師在鼓樓醫院見到了可怕的一幕。他寫道：“一名19歲的姑娘壞了六個半月的身孕，因反抗日本兵強暴，臉上有七處傷疤，腿上有八處，肚子上有一處深兩英寸，正是這一刀導致了她的流產，醫生們正在搶救她。”
12月31日，星期五。馬吉牧師在金陵大學醫院，見到了一位渾身是血的十三四歲的男孩。這個孩子在常州被日軍抓來幹活，有一天他對日本人抱怨已經兩天沒吃過飯，並要求回家。一個日本兵當即用鐵棍打他，並用刺刀刺穿了他的耳朵。他還見到了一位被日本人澆上汽油焚燒的小船主，他全身被燒得漆黑，很快死在醫院。
1月11日，星期二。馬吉牧師寫道：“昨天在醫院看到一名婦女被砍了數刀，頭都快掉了。這名婦女同其它四名婦女一起被日本兵從金陵大學抓走，這些日本兵需要一些婦女為他們洗衣裳和服侍他們。據這名婦女說，她們中年輕漂亮些的白天洗衣服，夜晚還要被強姦40次。有一天，兩個日本兵叫她跟她們走，她們把她帶到一個空房子裡，在那裡想把她的頭割下來，幸運的是沒割到要害部位。”
馬吉牧師控訴日軍的瘋狂的性暴力行為，認為日本軍方並沒有採取措施限制這些戰爭暴行的發生，因為日本人都不把這種暴行當回事，並不以此為恥辱。他曾經向日本外交官和《朝日新聞》的記者反映過這些暴行，這些人不約而同地說，“這是不可避免的”，卻沒有采取任何措施。