1、擦拭法：用化學藥液擦拭被汙染的物體表面，常用於地面、傢俱、陳列物品的消毒。如用0．5％-3％漂白粉澄清液、84消毒液等含氯消毒劑(現市場都出售，要看好有效期及使用方法)，擦拭牆壁、床、桌椅地面及廁所。
2、浸泡法：將被消毒物品浸泡在消毒液中，常用於不能或不便蒸煮的生活用具。浸泡時間的長短因物品及溶液的性質而有不同。如用1％-3％漂白粉澄清液浸泡餐具、便器需1小時，用0.5％“84”消毒液浸泡需15分鐘，而用0.02％高效消毒片浸泡只需5分鐘，就可以達到目的。若浸泡嘔吐物及排洩物，不但消毒液濃度要加倍，而且浸泡時間也要加倍。
3、燻蒸法：是利用消毒藥品所產生的氣體進行消毒。常用於傳染病人居住過的房間空氣及室內表面消毒。福爾馬林(甲醛)+高錳酸鉀：每立方米加入福爾馬林25—40毫升，高錳酸鉀15—30克，兩種藥放置在一起即產生氣體，可達到消毒目的。消毒時，必須將門窗緊閉12-24／小時，消毒後再開啟門窗進行通風，此法對各種細菌、病毒引起的傳染病均有效。食醋：每立方米用3-10毫升食醋，加水2～3倍加熱燻蒸，用於室內空氣消毒，對於預防流感等呼吸道傳染病有效。
1、噴灑消毒，將消毒藥用水稀釋成合適的濃度來噴灑消毒，主要用於畜禽舍、籠具、飼養場地、運輸工具及排洩物，周邊環境的消毒。
2、燻蒸消毒，一般用甲醛和高錳酸鉀混合發生反應，產生的氣體具有強烈的刺激性氣味來達到消毒的目的，多用於密封舍的消毒和種蛋消毒。燻蒸消毒必須有較高的室溫和相對溼度，室溫不低於15℃，相對溼度為60%～80%，消毒時間為8～10小時。
3、飲水消毒將消毒劑稀釋到合適的濃度，即將消毒藥加入一定量的水中，讓畜禽自由飲用，來消除腸道病菌。
4、浸泡消毒用於浸泡用具、器械的消毒。
1、熱滅菌法。熱滅菌法利用高溫使微生物細胞內的一切蛋白質變性，酶活性消失，致使細胞死亡。通常有乾熱、溼熱和間歇加熱滅菌等法。
2、乾熱滅菌。火焰灼燒法或烘箱內熱空氣滅菌法稱為乾熱滅菌法（dryheatsterilization）。把金屬器械或洗淨的玻璃器皿放入電熱烘箱內，在150～170℃下維持1～2小時後，可達到徹底滅菌（包括細菌的芽孢）的目的。灼燒（incineration或combustion）是一種最徹底的乾熱滅菌法，應用範圍僅限於接種環、接種針的滅菌或帶病原菌的材料、動物屍體的燒燬等。
3、化學試劑滅菌。大多數化學藥劑在低濃度下起抑菌作用,高濃度下起殺菌作用。常用5%石炭酸、70%乙醇和乙二醇等。化學滅菌劑必須有揮發性，以便清除滅菌後材料上殘餘的藥物。化學滅菌常用的試劑有表面消毒劑、抗代謝藥物（磺胺類等）、抗生素、生物藥物素抗生素是一類有微生物或其他生物生命活動過程中的合成的次生代謝產物或人工衍生物，他們在很低濃度時就能抑制或感染它種生物（包括病原菌，病毒，癌細胞等）的生命活動，因而可用作優良的化學治療劑。
4、間歇滅菌。間歇滅菌連續3天,每天進行一次蒸氣滅菌的方法。此法適用於不能耐 100℃以上溫度的物質和一些糖類或蛋白質類物質。一般是在正常大氣壓下用蒸氣滅菌1小時。滅菌溫度不超過100℃,不致造成糖類等物質的破壞，而可將間歇培養期間萌發的孢子殺死，從而達到徹底滅菌的目的。
5、輻射滅菌。輻射滅菌在一定條件下利用射線進行滅菌的方法。較常用的有紫外線，其他還有電離輻射（射線加快中子等）。波長在25000～80000奈米之間的鐳射也有強烈的殺菌能力,以波長26500奈米最有效。輻射滅菌法僅限於某一定材料，因所需裝置複雜，難於廣泛使用。
6、消毒劑消毒法。 消毒是指殺死病原微生物的方法。但化學消毒劑大多僅能殺死微生物的繁殖體而不能殺死芽孢，能控制一定範圍的無菌狀態。可將消毒劑配成適宜濃度，採用噴淋、塗擦或浸泡等方法對物料、環境、器具等進行消毒。常用的化學消毒劑有0.1%～0.2%苯扎溴銨溶液、3%～5%的酚或煤酚皂溶液、75%乙醇等。常用於物體表面滅菌。但要注意其濃度不要過高，以防止化學腐蝕作用。潔淨室的牆面、天花板、門窗、機器裝置、儀器、操作檯、車、桌、椅等表面以及人體雙手（手套）在環境驗證及日常生產時，應定期清潔並用消毒劑噴灑，無菌室用的消毒劑必須在層流工作臺中，用0.22μm的濾膜過濾後方能使用。