《產科男醫生》以婦產科為背景，以一群男醫生為主要人物，他們都是婦產科的大夫，醫術精明，卻因性別遭到家屬的質疑，不僅如此，他們的女朋友、愛人也因為他們的工作性質與其產生種種矛盾，由此引發了一系列故事。
劇中賈乃亮飾演的左右是一名婦產科男醫生，但他並不喜歡自己的工作，卻在父親左盛德的逼迫下不得不留在自己的崗位上，李小璐飾演的錢小小是左盛德的得意門生，她和左右曾產生諸多矛盾，不過在相處過程中，兩人逐漸愛上了對方。
朱軼飾演的董思賢是錢家養子，也是一名婦產科男醫生，雖然在婦產科中，他迎來一個又一個新生命的誕生，但他和妻子卻始終沒有一個屬於自己的孩子，無奈之下，妻子錢蕾只能選擇和他離婚，但兩人之間仍然還有感情。
在婦產科，雖然新生兒的誕生令人欣喜不已，卻也有各種各樣的危險發生，正是這些醫生、護士們的共同努力，才能將病人從鬼門關救回來，在這一過程中，左右逐漸感受到身為醫生的使命，逐漸愛上了這份工作，而婦產科的故事，也將繼續發展下去。
華南醫院婦產科前任男主任左老，為熱愛的婦產科事業奉獻了一生，而身在婦產科的兒子左右卻並不喜歡自己的工作，不但與父親矛盾衝突不斷，還跟父親的女研究生錢小小心存芥蒂。新任男主任董思賢，在自己熱愛的工作崗位上，為他人迎來一個又一個的新生命，與妻子錢蕾卻一直沒能迎來自己的孩子，兩人甚至因此倉促地結束了婚姻。然而正如左老所深信的那樣，婦產科是個誕生生命的地方，也是個創造奇蹟的地方。在一次次性命攸關的爭分奪秒裡，左右漸漸愛上了這個工作，收穫了與小小的愛情，也更加理解了父親。董思 賢對積極尋找新戀情的錢蕾依然關懷備至 ，兩人始終無法割捨對方，錢蕾意外懷孕 ，無形中為董思賢摘掉了不育症者的帽子 。終於，董思賢在婦產科迎來了女兒的誕生。分手的夫婦重新走到了一起。婦產科的醫生們繼續著他們關於愛與責任、理解和成長的故事。
1、第1集婦產科日常左右希望辭職左右是一名年輕的產科男醫生，父親左盛德是婦產科的主任。雖然年輕有為，但是左右卻十分不想要做婦產科醫生，因為這個職業男性來做總是被人誤解，自己也找不到女朋友。左右的科室裡面收到了一位昏迷的懷孕產婦，病情十分嚴重。
2、第2集感情危機錢蕾董思賢爭執錢蕾是董思賢的妻子，看到董思賢匆忙離開機場以後只能獨自離開機場，結果偶然遇到了自己過去的男友Eric，Eric對錢蕾一直念念不望。錢蕾為了氣董思賢，故意和Eric一起吃飯買東西。董思賢和錢蕾在家中發生了爭執，董思賢說著說著睡了過去，讓錢蕾很是生氣。
3、第3集李娜與丈夫聽說孩子兔唇，不肯認孩子。為了讓李娜和丈夫認回孩子，左右施計騙李娜孩子丟了，以喚起父母之愛，結果孩子真的丟了。李娜丈夫認為是左右在報復自己，與左右再次衝突。透過監控錄影發現孩子被手術摘除子宮要孩子無望的病人崔珍玲偷走，左右替李娜找回孩子，使得李娜一家團圓。李娜丈夫向左右認錯，並給左右一個紅包，左右將紅包扔進了捐款箱。左右收紅包的事情被馬悅瞧見並報告，左右被誤會。侯晚晴約左右在咖啡館見面和解，結果卻談崩了，侯晚晴離開，左右追出來挽留，分享者影視，出來巧遇被錢母帶來相親的錢小小。侯晚晴誤會左右是想和自己分手而找錢小小來演戲，率先提出分手。左右歸咎於錢小小，生錢小小的氣。錢小小相親不如意，被相親物件氣著，左右見到錢小小準備發作的一幕。左右和錢小小在吵嘴中相互諒解，轉而相互開釋，兩人暫時握手言和。董思賢與錢蕾玩浪漫去看日出，結果遇雨，兩人淋雨失望回家，董思賢被凍感冒。
4、第4集不情願調職左右來到兒科婦產科再次迎來了新病人，一名叫做王瑩的孕婦就要生孩子了，她的丈夫委託李大齊幫助自己拍攝下來王瑩生孩子的過程。李大齊和左盛德認識，於是想辦法混進了醫院，來到了手術室中放置下來了錄影機，隨後王瑩進入了產房生產，攝影機順利的拍攝下來了生產的過程。李大齊想辦法拿出攝影器材的時候被錢小小給撞見了，錢小小發現了他留下來的錄影機。
5、第5集婚姻意外錢蕾出軌產科的日常在繼續進行著，產婦陳丹因為認為二月二這一天生孩子十分的吉利，於是詢問產科副主任董思賢，能否將自己生孩子的日子改到二月二這一天。董思賢拒絕了，認為這樣子對身體不好。陳丹不死心，繼續詢問錢小小，錢小小明白的告訴對方在二月二這一天陳丹的孩子還沒有足月，沒有足月生產不僅對孩子不好，對孕婦的安危也會造成很大威脅。