1、外觀不同：花菇的頭部是淡黑色，而底部是淡黃色，表面有白色的花紋，所以叫做花菇，香菇雖然都是淡黑色，但是表面沒有白色的花紋。
2、生長環境不同：香菇是在陽光充足、低溫、少雨的時候形成的。花菇是香菇在受到外界溫差大、高溫的環境下形成的，也就是說花菇是香菇在接受外界刺激下長成的。
3、營養價值不同：香菇裡面含有大量的維生素，這些物質對於治療感冒、預防疾病有很好的效果。花菇則具有健身、防衰老的功效，很多人都喜歡吃花菇，但是由於花菇的產量比較少，所以價格也相對比較高。
4、烹飪做法不同：平時都習慣把香菇炒菜吃，但也有煲湯的，但是香菇由於自己獨特的香味，如果炒菜吃就會破壞裡面的營養物質，所以可以建議大家煲湯喝，花菇則可以炒菜，因為它是經過充足的陽光與水份之後的產物，所以裡面的營養物質含量比較充足。
1、品類區別。花菇嚴格意義上來說是香菇的一個品種，它的形成是在香菇生產時透過調控溫度、溼度、光照和通風等條件，改變了香菇原本的生長髮育，導致香菇菌蓋開裂，才形成花菇。因其對於生長條件較高，一旦生長條件不足就會失敗，雖然是透過香菇得來的，但是它的營養價值高和口感都是香菇的數倍，所以和香菇隔絕開，成為一個新的食用菌品種。
2、外觀區別。它們的外觀極易分辨，香菇表面光滑，個頭較少，菌蓋一般為褐色或灰色，我們日常生活中比較常見。而花菇之所以名為花菇，主要是它的菌蓋有褐白相間的花紋，曬乾之後就會形成一朵朵花，這時香菇所不具有的特點，而且它的個頭要比香菇要大，菌蓋顏色有黃色、灰色以及褐色等多種顏色。
3、生長環境區別。它們的生長環境也有很大的青年，香菇喜歡在低溫、少雨、光照充足、溫度較大的環境中，在適宜的環境下生長極快。而花菇時香菇遇到特殊的環境才形成的變異品種，它的生長條件十分苛刻，適宜生長溫度在5-22度之間，在出菇時要保持相對溼度在70%以內，以及較大的溫差變化才會形成，一旦那個條件不適宜，它就會形成失敗。
4、營養區別。香菇和花菇都含有大量的蛋白質和不飽和脂肪酸，還有多種對人體有益的營養成分，但是它們的營養價值好存在一些差異。花菇各種營養成分都要比香菇要高，而且這些成分在進入到人體後就會轉化層麥角甾醇，它能增強人體的抵抗力，預防多種疾病，還能延緩衰老，這是香菇所沒有的。
外觀不同：花菇的頭部是淡黑色，而底部是淡黃色，表面有白色的花紋，所以都叫做花菇香菇雖然都是淡黑色，但是表面沒有白色的花紋。還有一點就是花菇比香菇大一點兒。
生長環境不同：香菇是在陽光充足、低溫、少雨的時候形成的。花菇是香菇在受到外界溫差大、高溫的環境下形成的，也就是說花菇是香菇在接受外界刺激下長成的。
營養價值不同：香菇裡面含有大量的維生素，這些物質對於治療感冒、預防疾病有很好的效果花菇則具有健身、防衰老的功效，很多人都喜歡吃花菇，但是由於花菇的產量比較少，所以價格也相對比較高。
烹飪做法不同：平時都習慣把香菇炒菜吃，但也有煲湯的，但是香菇由於自己獨特的香味，如果炒菜吃就會破壞裡面的營養物質，所以可以建議大家煲湯喝，