第一部《怪獸之決鬥》：決鬥者王國篇，戰鬥城市前篇乃亞篇，戰鬥城市後篇，多瑪篇，KC賽篇，王之記憶篇，共有224集。第二部《怪獸之決鬥GX》：三幻魔篇，光之波動篇，尤貝爾篇，Darkness篇，共有180集。第三部《 遊戲王5D》：序章，幸運杯決鬥篇，幸運杯決鬥篇，WRGP篇，衝突鎮篇，永轉機篇，共有154集。
第一部《怪獸之決鬥》：決鬥者王國篇，戰鬥城市前篇乃亞篇，戰鬥城市後篇，多瑪篇，KC賽篇，王之記憶篇，共有224集。第二部《怪獸之決鬥GX》：三幻魔篇，光之波動篇，尤貝爾篇，Darkness篇，共有180集。第三部《 遊戲王5D》：序章，幸運杯決鬥篇，幸運杯決鬥篇，WRGP篇，衝突鎮篇，永轉機篇，共有154集。
遊戲王一共有五部，第1部是《遊戲王DM》，第2部《遊戲王GX》，第3部是《遊戲王5D》，第4部是《遊戲王zexal》，第5部是《遊戲王ARCV》。
第一部主要講述了遊戲王卡片的來歷，在很多年前的古埃及中，有一種遊戲可以預知到未來，而且這種遊戲還能啟動很多的魔法陣型。在裡面有一種叫做黑暗遊戲的挑戰模式，也就是千年積木的形象，這個倒金字塔也是法老王的離婚所在處，隨後有一名少年完成了這個遊戲所有的環節，並將這些卡牌遊戲稱為遊戲王。
第二部的GM主角換成了遊城十代。他是一個來參加學院決鬥測試的學生，然而在路上碰到了武藤遊戲，武藤遊戲很看好十代的天賦，給了他一個特殊的卡片“羽翼栗子球”。隨後的故事中十代在學院大展風采，用自己的英雄牌組戰勝了很多人。在七星篇章中，十代打敗了三幻魔的卡牌。在破滅之光中，十代遇到了極其特殊的卡牌，命運英雄血魔，但是十代沒有放棄，抓住了利用魔法卡和陷阱卡的機會戰勝了他。在異次元中，十代和朋友們被困在了心魔世界，但是十代利用自己的意志力打敗了霸王十代。在最終的darkness中，因為上次的事件導致黑魔王誕生，十代和朋友們盡全力才將敵人消滅。
第三部《遊戲王5D》講述了主角不動遊星的經歷。在第一部結束的十年後，這個城市的管理制度逐漸完善，但是地位階級也更加明顯，可以說就是弱肉強食，主角不動遊星就是利用騎乘決鬥來和敵人作戰。
第四部《遊戲王zexal》分為兩季，主角的名字叫做九十九遊馬。在第一季中，遊馬所在的城市成為了AR對決，也就是說現在的遊戲王更加完善，能夠進行實體化，遊馬在經歷中遇到了很奇怪的星光體。第二季就是講述了遊馬拯救星光體，和兩個強敵快鬥、凌牙決鬥的故事。
第五部《遊戲王ARCVA》有一些往娛樂方向發展了。這一部並沒有邪惡的敵人，主角榊遊矢在這個城市中需要參加動作決鬥，城市中分佈著很多不同的組織機構。
第106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、147、148、151、152分別出現寶玉獸。
寶玉獸是遊戲王卡組之一。《遊戲王GX》中約翰安德森使用的卡組系列。寶玉獸的共同特點是從怪獸區域被破壞時，可以不送去墓地而當作永續魔法卡在魔法與陷阱區域放置。
根據《遊戲王GX》動畫的介紹，七顆價值不菲的寶石是古代某個信奉寶石力量的