醫用防護口罩除衛生要求較高外，還應具有有效阻隔液體噴濺的功能。由於在手術中，存在血液或具有傳染性體液噴濺的可能性，這種噴濺具有一定的壓力，並非一般的液體浸潤，口罩材料阻隔有壓力液體的能力應比較高，只有這樣，才能有效保護醫護人員。所以在醫用防護口罩的標準中，採用了特殊的檢測方法來測試這類產品的阻隔液體效能，而一般的工業性環境使用的防護口罩，不需要有這種特殊要求，檢測標準中也自然沒有這類規定。
另外，醫用防護口罩不允許有呼氣閥。這是由於醫用防護口罩允許作為外科手術口罩使用時，如果佩戴有呼氣閥的口罩，會將呼氣中所攜帶的微生物直接排出口罩外，對接受手術的患者構成威脅。而許多工業用的防護口罩都有呼氣閥的設計，呼氣閥是一個單向的閥門，當使用者吸氣時，口罩內部為負壓，閥門關閉，空氣從過濾材料進入呼吸區；呼氣時，口罩內為正壓，呼氣閥開啟，呼氣直接排出。這種設計是為減小呼氣阻力，幫助排出溼熱空氣，感覺相對地涼爽些。
1、從口罩結構入手，無論是醫用口罩或是工業用口罩。必定由三層組成：內、中、外。內層一般是與臉部肌膚親和的阻隔層；中部一般為過濾效果較高的隔離過濾層；外部則為普通隔離層。
2、醫用口罩除了防細菌、病毒外。最主要的功能在於阻隔液體噴濺。這點是區分於其他口罩的關鍵點。如血液等具有傳染性的液體噴濺是具備一定壓力的，也有一定粘稠度。要使得液體不浸潤於口罩。因而有阻隔有壓液體之類需求的，選用醫用口罩是再好不過的選擇。
3、醫用口罩也有其職業特點，各層均是具備抑菌效果的特殊材料。佩戴輕便、呼吸阻力小等相對於工業用口罩的優勢凸顯。但是醫用口罩，尤其是市面上銷售的一次性口罩，由於缺乏充靜電的纖維層，故而對於之前經驗中所提到的徑度小於5微米顆粒阻擋程度有限。因此用醫用口罩來防護霧霾的效果不可稱之為理想。
4、一般的工業用口罩並無阻隔液體效能的要求，因此對於工業用口罩的檢測標準中也無這項檢測。而區分的明顯特徵在於呼吸閥。醫用口罩無呼吸閥的原因就在於不允許將微生物直接排出口罩外，尤其在於外科手術時。因而無菌環境中，帶有呼吸閥的口罩是絕不能使用的。
5、工業環境大多在悶熱環境中，勞動量大。口罩內撥出的氣體在密封情況下與外界空氣流動變得緩慢。呼吸閥的作用就在於加速空氣流通。尤其是降低密封環境內的悶熱和潮溼不適感。
6、在霧霾空氣中，我們需要口罩營造一個密封的空間，從而透過過濾層，過濾出新鮮空氣。而長時間的在霧霾空氣中，口罩內空氣就會變得悶熱和潮溼。最理想的防護效果在於將醫用口罩與工業用口罩的優點相結合，但是這不僅帶來生產成本的提高，並且“強強聯手”未必有最優效果。因此，選購時更應偏向於所處環境的考慮出發。
1、過濾率
過濾率是醫用口罩與防護口罩的區別之一，防護口罩對於非油性顆粒物的過濾率可達到95%以上，是應對空氣傳播疾病常用的個人防護用品。而醫用口罩能夠阻隔血液、體液穿過口罩汙染佩戴者，對細菌的過濾率為70%以上，對顆粒物的過濾率有限。
2、形狀
防護口罩與佩戴者的面部有較好的貼合性，是一款防護非常嚴密的口罩，常見的防護口罩有拱形、蝶形等。而醫用口罩與面部的貼合性沒有那麼嚴密，常見的醫用口罩有綁帶式、耳掛式等款式。
3、適用範圍
醫用口罩顧名思義是醫務人員使用的口罩，這種口罩是臨床醫務人員給患者實施相關的救治措施必不可少的防護用品。而防護口罩的適用範圍較廣，常人可以使用，在車間工作的工人也可以使用。