1、鹿目圓，因為一個龐大的願望——“魔法少女在絕望之後變為魔女”這一悲劇連鎖可以終結而讓自己成為了世界的一種概念，失了本身的身體。
2、美樹沙耶香，作為小圓的好友，她是以一名以治療為願望的魔法少女。
3、巴麻美，小圓與沙耶香的的前輩，很早就存在於見瀧源市的魔法少女。
4、佐倉杏子，鄰町的魔法少女，因為某個願望而導致家庭破碎，從此決意只將魔法的力量用於自己。
5、見瀧源市，因為長期以來受著著四位魔法少女的守護才能一直呈現著一幅寧靜祥和的景象。為了守護這座她們共同珍惜的城市，保護所珍視的家人和朋友，她們一次又一次在見瀧源市擊敗滋生於人類靈魂深處產生的“夢靨”。一次意外，她們發現新轉學來的同班同學曉美焰竟然也是魔法少女的一員。因為擁有共同的力量，因為心懷某種願望，她們站到了一處，從此齊心協力，解決了夢靨接二連三帶來的危機然而，面對周遭無時不在的違和感，心中的隱隱不安彷彿在驅使著曉美焰往哪裡去似的。最終，她要求杏子和她去風見野一探究竟。只是令她們萬萬想不到的是，幾番周折過後她們竟然還無法走出見瀧源。見瀧源似乎是被什麼人刻意封在了某種結界之中，而這亦是導致魔法少女們陷入無休止的混亂深淵的緣故。
1、就讀市立見瀧原中學二年級的少女鹿目圓是個出生於良好家庭，親朋好友，有哭有笑，什麼都擁有的日常生活的女孩。有一天，一名神秘轉學生曉美焰的出現，讓小圓開始改變了自己的命運。 小圓和朋友在回家途中發現一隻暗中喊求救人話的神秘生物，已經傷痕累累。追殺這個神秘生物的人，竟然是小圓認識的神秘轉校生曉美焰。之後遇上小圓的同校學生巴麻美后，神秘生物透露出自己的身份。自稱是“丘比”的神秘生物要少女們“和自己訂下契約成為魔法少女”。 但現實遠比小圓所想的越來越殘酷，魔法少女的真相一再衝擊著小圓想成為魔法少女的想法。
2、《魔法少女小圓劇場版 [前篇] 起始的物語》、《魔法少女小圓劇場版 [後篇] 永遠的物語》二部曲把《魔法少女小圓》TV動畫版以總集編的形式進行重新制作，而最後一部《叛逆の物語》則將會是上演全新的故事。前編《始まりの物語》後編《永遠の物語》Blu-ray&DVD;已於2013年7月24日發售。
1、小圓犧牲了自己，重新創造了宇宙。設定了全新的魔法少女規則，改寫了所有魔法少女的命運。（即魔法少女不會再變成魔女）代價則是她所有的“記錄”全都消失了。
2、曉美焰因為擁有操控時間的力量，得以保留了小圓在她這裡的“記錄”。而因為魔法少女不會變為魔女，導致絕對存在的世間一切之惡換了一種存在（或者說詛咒方式。即透過自然集合來產生魔女 這同樣需要魔法少女來消滅這些詛咒集合體。
3、但是與以前不同的是，魔法少女獲得了些許存在的意義，即死後不會對世界產生直接的危害。即努力消滅魔女變得有意義了。雖然被消滅了的“惡”依舊會透過某種方式重新復活，但對於魔法少女本身來說，關係也就不那麼大，至少被她殺掉的“惡”是不知能危害他人了（類似於將危害延後）。