1、不管什麼原因導致的魚缸出現腥臭味，如果經常性發臭，只要條件允許，最好進行一次徹底處理。把魚暫時轉移到其他魚缸或容器，把魚缸騰空，然後把髒魚缸用消毒殺菌劑浸泡清洗一遍，一般用白醋、食用或是消毒酒精、高錳酸鉀溶液、漂白粉、84消毒液等均可，這樣不但能殺菌，也能去味，注意，消毒劑泡洗後一定要用清水充分沖洗掉消毒劑。清洗乾淨後，就把魚缸放在烈日下暴曬幾天。如果沒有消毒劑或是害怕消毒劑洗不乾淨危害寵物魚，不能用消毒劑殺菌，則在用清水刷洗一遍後，可以用紫外燈照射魚缸進行殺菌，然後再用烈日暴曬幾天。如果遇上陰雨天沒有辦法用烈日暴曬，則可以用電吹風開到最高熱檔，對著魚缸反覆吹一個小時左右，然後靜置幾天。浴缸裡的底沙、景觀石等必須物和飾物也需要消毒去腥。這樣處理後，往往能減少發臭的頻率，就算發臭也能減輕腥味。
2、多數出現的魚缸腥臭，是因為水質變差，把水換了就沒事啦。魚的糞便、食物殘渣、水草枯枝敗葉等廢物久置魚缸都會腐爛滋生細菌導致魚缸發臭。因此，要定期清理各種殘渣，發現水質變渾了就要及時換水。一些養魚人為魚缸配置了過濾，因此認為可以不換水。這種觀點是錯誤的，過濾雖然能比較長維持水質，但過濾系統也可能會功能減弱，或是所安裝的過濾系統本就效能不佳，這種情況下，過濾只是延緩了水體變質的速度，水體最終還是要變質的，所以，即使有過濾，也要定期換水，防止發臭。此外，過濾系統也要定期檢查，過濾能力快速下降後，要及時換過濾材料。
3、死魚也是導致魚缸發臭的一個原因。寵物魚死亡後，很快就會腐敗並大量滋生細菌導致魚缸發臭，因此死魚要第一時間撈出來，防止發臭。對於沒能及時把死魚撈出來導致魚缸腥臭，這種腥臭味很重且頑固，用一般清水和清潔劑都難以徹底洗去，可以用開頭所提的方法進行徹底處理。
4、魚卵一般都有一種特殊的腥味，失去f發育能力的魚卵很快就會腐敗，一旦在魚缸裡停留時間過長，就會導致水體發出特別的腥臭味。當養的魚產卵後，如果不需要繁殖魚苗，就立即撈起來做棄置處理，如果要繁殖魚苗，則也要撈起來，放到專門的繁殖容器裡進行繁殖，防止出現死卵導致水體發臭。已經出現死卵導致魚缸發臭的情況，就立即打撈死卵，清洗魚缸，換水，即可解決腥味問題。
5、魚身體受傷後，如果傷口發炎腐爛，往往就會導致水體發臭。因此，一旦發現魚受傷創口比較大，一定要積極給它治療，防止發炎。對於已經發炎的魚，要一面進行消炎治療，同時勤換水以減輕腥臭味；對於嚴重發炎的魚，最好做棄置處理，這樣的魚太影響水質，再怎麼換水還是要快速發臭，若實在無法忍痛捨棄，就撈起來單獨一個魚缸養著。
6、水體的溶解氧長期不足，也會導致魚缸發臭。溶解氧不足，會導致魚類厭食，食物殘渣增多，魚類的排洩物也特別腥臭，缺氧也會導致水草和好氧細菌死亡。長期缺氧往往是養殖密度過大導致的，這樣的情況不是換水能解決的，徹底解決的辦法是降低養殖密度，或是採用機器增氧，從魚兒健康的角度來說，本人建議還是從合理養殖密度下手。
7、長期空氣流通不好，會導致水體溶解氧長期不足。此外，長時間陰雨沉悶和悶熱天氣，由於氣壓劇烈變化，水體溶解氧也會出現長期不足。這兩種情況下，也會導致缺氧性腥臭。先換水去除腥味，然後配置增氧泵給魚缸供氧，防止發臭。
8、用來養魚的水有問題，微生物過量，會導致魚缸的水質快速變差，併發出濃重腥味。很多家庭都是由自來水公司供水，而自來水公司的供水質量差眾所周知，甚至供來的水，剛放出來就有一股濃重的腥味，這樣的水養魚，稍稍換水次數少一點，就會腥臭難聞。在沒有選擇的情況下，可以自己動手給自來水殺菌，如果魚缸小需水不多，就把水燒開，然後靜置晾涼一兩天，換水前用氣泵給水體增氧一小時；對於大魚缸，就用消毒劑給自來水殺菌，或是用強紫外線照射自來水，經過處理的自來水靜置幾天，再給魚缸換上。
9、多數魚自身都有一股腥味，只是腥味的輕重不同而已。有的人嗅覺很靈敏，超乎常人的嗅覺會讓這些養魚人無論採取什麼措施都感覺魚缸腥味很嚴重，其實，魚缸很正常，他們聞到的腥味是魚本身的體味，是無法徹底去掉的。對於這種嗅覺超常的人，不建議養魚，或是跟魚保持距離。不少嗅覺超常的人不自知，就會無辜折騰自己和魚，這種情況可以對比家人和周圍人對魚缸的感受，如果別人都感覺不出腥味，那就可以判定出自己可能是嗅覺超常了。
10、魚體表寄生蟲和細菌大量繁殖，也會導致水體經常發臭。對於這種情況，除了可以給魚打針或服藥，也可以用高錳酸鉀對魚洗一下身體滅菌，同時對魚缸消毒殺菌。