1、相同點：防護等級相同，均透過N95等級檢測，符合美國國家職業安全及健康協會標準（NIOSH）N95認可。隔濾的微粒，直徑可小至0.3微米。在測試中，隔阻直徑0.075微米的微粒，成功率有95%。冠狀病毒肺炎（非典型肺炎）病毒的直徑約0.1至0.12微米。所以理論上都是可以用來防流感病毒的，故而在發生疫情時均可認為是標準的防護口罩。
2、差異點：防護型別：一種是醫用口罩，另一種屬於工業防塵口罩。當然，兩者對應的認證標準不同。
3、使用範圍：N95醫用防護口罩對用於醫療衛生行業，比如防疫站、醫院、疾控中心等；N95口罩對用於工業，比如煤礦業、石油加工、採礦業等工礦企業使用。
4、作用用途：N95醫用防護口罩在防護病毒的同時，還能過濾細小顆粒粉塵；而N95防塵口罩只能有效阻隔粉塵，對病毒病菌不能很好的防護。
5、使用材質：N95口罩一般分“外中內”三層，中間隔濾層其濾徑雖然相同，但三層的選用材質有差別。
6、液體防護：由於N95醫用防護口罩有阻隔液體噴濺功能的需要，口罩的外層表面多一層綠色的疏水防護層，主要作用是可以防護輕微的液體或血液的飛濺滲透。而N95口罩是沒有這層疏水防護層的。
1、過濾率
過濾率是醫用口罩與防護口罩的區別之一，防護口罩對於非油性顆粒物的過濾率可達到95%以上，是應對空氣傳播疾病常用的個人防護用品。而醫用口罩能夠阻隔血液、體液穿過口罩汙染佩戴者，對細菌的過濾率為70%以上，對顆粒物的過濾率有限。
2、形狀
防護口罩與佩戴者的面部有較好的貼合性，是一款防護非常嚴密的口罩，常見的防護口罩有拱形、蝶形等。而醫用口罩與面部的貼合性沒有那麼嚴密，常見的醫用口罩有綁帶式、耳掛式等款式。
3、適用範圍
醫用口罩顧名思義是醫務人員使用的口罩，這種口罩是臨床醫務人員給患者實施相關的救治措施必不可少的防護用品。而防護口罩的適用範圍較廣，常人可以使用，在車間工作的工人也可以使用。
對非油性顆粒物質的過濾率不同，適用場合不同。防護口罩能夠有效過濾空氣中的微粒、飛沫、血液、體液等汙染物，對於非油性顆粒物質的過濾率一般都達到９５％以上，適用於人流量大、環境複雜的場合。而醫用口罩也能夠阻擋外界的血液、飛沫汙染佩戴者，但是它對於非油性顆粒物質的過濾率一般在７０％以上，適用於一般公眾場合。
防護口罩：分為供氣式防護口罩和濾氣式防護口罩。濾氣式口罩可過濾空氣中的微粒，阻隔飛沫、血液、體液、有毒氣體、分泌物。供氣式防護口罩是指在化工廠所、火災現場及兵工化學危害等場所的供氣式防護口罩，即普通單兵防護口罩。
醫用口罩：是一種醫療防護用紡織品，多采用一層或者多層非織造布覆合製作而成，主要生產工藝包括熔噴、紡粘、熱風或者針刺等，具有抵抗液體、過濾顆粒物和細菌等效用。