亞基與蛋白質三級結構概念的辨析

　　每一條多肽鏈都有其完整的三級結構，稱為亞基。亞基之間呈特定的三維空間排布，並以非共價鍵相連線。

　　蛋白質的三級結構是指球狀蛋白質的多肽鏈在二級結構的基礎上相互配置而形成的特定構想。

　　亞基是蛋白質的一種三級結構。蛋白質的三級結構就是蛋白質的空間結構（所有原子的空間座標組成）。一個多聚體蛋白質是由多個亞基組成的。

　　維持蛋白質三級結構穩定的因素是次級鍵，次級鍵除了典型的強化學鍵等，依靠氫鍵以及弱的共價鍵和範德華作用力，即分子間作用力，相結合的各種分子內和分子間作用力的總稱。

　　氫鍵(X—H…Y)和沒有氫原子參加的X…Y間弱作用力都屬於次級鍵。次級鍵可根據原子間的距離、核磁共振譜和光譜等實驗資料來確定。化學反應過程中形成的過渡態正是以次級鍵為特徵的中間體或活化絡合體。次級鍵在物質的結構和性質的研究以及生物體系和超分子化學中起重大作用。

　　反映在分子結構上，當原子間距離小於或接近相應的離子半徑、共價半徑或金屬半徑之和時，可以認為原子間形成了化學鍵；當不同分子中的原子間距離範德華半徑之和時，可以認為分子間存在著範德華力；當原子間距離介於化學鍵與範德華力範圍之間時，可以認為原子間生成次級鍵。

　　維持蛋白質三級結構的作用力是氨基酸側鏈之間的疏水相互作用，氫鍵，範德華力和靜電作用。

　　蛋白質三級結構是指一條多肽鏈在二級結構或者超二級結構甚至結構域的基礎上，進一步盤繞，摺疊，依靠次級鍵的維繫固定所形成的特定空間結構稱為蛋白質的三級結構。

　　蛋白質三級結構的特點為：

　　含多種二級結構單元；有明顯的摺疊層次；為緊密的球狀或橢球狀實體；分子表面有一空穴；疏水側鏈埋藏在分子內部，親水側鏈暴露在分子表面。