1、發行主體不同：公司債券目前僅能由上市的股份有限公司發行。
2、募集資金用途不同：企業債券的募集資金一般用於基礎設施建設、固定資產投資、公益事業投資等方面;而公司債券可根據公司自身的具體經營需要提出發行需求。
3、監管機構不同：公司債券的發行實行核准制，中國證監會稽核發債公司的材料是否符合法律制度規定。而發行企業債則由國家發改委審批。
4、對資訊披露要求的差異：企業債券的發行人沒有嚴格的資訊披露義務;公司債券發行人的資訊披露較為嚴格。
【法律依據】
《公司法》第一百五十五條規定，公司以實物券方式發行公司債券的，必須在債券上載明公司名稱、債券票面金額、利率、償還期限等事項，並由法定代表人簽名，公司蓋章。
法律性質不同：股票屬於所有權證書。股東在法律上享有特定財產權即股權，股票持有人是公司所有者。而債券屬於一種債權憑證，債券持有人和債券發行人之間的法律關係屬於債權債務關係。
法定權利和義務不同：股票持有人是公司的股東，是組成公司的成員。股票持有者有權參加股東大會並進行投票，有權參與公司的經營決策，分享股利和剩餘財產分配。但同時在自己股份內承擔風險責任。而公司債券的持有人是公司局外人，換而言之，持有人是公司的債權人，有權按照約定期限取得利息，收回本金，但無參與公司經營的法定權利，也無權分享公司剩餘財產。需要注意的一點是，但在公司清算時，有權比公司股東優先得到債務賠償。債券持有人對公司的經營狀況不需要承擔責任。
期限不同：股票投資屬於永久性投資，股東無法要求公司返還其本金，所以股票不存在到期日。而公司債券則有一定的清償期，到期後公司必須返還本金。
收益的風險與方式不同：除了優先股外，股票是沒有固定利息的，所以投資者的收益與企業經營狀況密切相關，只有公司在盈利的情況下才能分得利息和紅利，風險比較大。而公司債券則有固定的利息率，無論公司是否盈利，都須向債券持有人支付約定的利息。
徵稅方面的不同：股票的利息在稅後利潤中支付，債券的利息在稅前利潤中支付。
合作社與公司的區別如下：1、兩者的主體不同：農民專業合作社以農民為主體，農民佔到全體成員80％以上；而公司只要具有完全民事行為能力的自然人和法人。2、從事行業不同：農民專業合作社從事農業或農業服務；公司從事的行業只要經過批准不論哪一行。3、出資要求不同：合作社未設門檻，可以出資也可以不出資，由章程自行決定；公司出資人的出資額由最低法律限制和要求。4、組織目標不同：農民專業合作社不以營利為目的，謀求全體成員共同利益，是一種互助新經濟組織；公司以營利為目的，實現股東利益最大化。5、決策方式不同：農民專業合作社是一人一票制，實行民主管理；公司實行資本決策，按照出資比例行使表決權。6、分配方式不同：農民專業合作社以惠顧分配為主；而公司以資本比例分配。7、退出方式不同：農民專業合作社退社自由，無條件退還出資額和屬於個人的積累；公司則不能退出出資額，但可以轉讓。