建文帝的下落為葬身於火海。燕王破城，建文帝下令焚宮，攜皇后馬氏，跳入火中自焚。
《成祖本紀》說：“宮中火起，帝不知所終。燕王遣中使出帝后屍於火中”。
《太宗實錄》雲：“遂闔宮自已焚燃。上望見宮中煙起，急遣中使往救，至已不及，中使出其屍於火中，還白上，上哭曰，果然，若是痴呆耶！”
《明史·建文皇帝本紀》雲：“上入宮，忽火發，皇后馬氏暴崩，程濟奉上變僧服遁去。燕王遂入宮因指燼中後骨以為上！”。
建文帝的下落為葬身於火海。燕王破城，建文帝下令焚宮，攜皇后馬氏，跳入火中自焚。
《成祖本紀》說：“宮中火起，帝不知所終。燕王遣中使出帝后屍於火中”。
《太宗實錄》雲：“遂闔宮自已焚燃。上望見宮中煙起，急遣中使往救，至已不及，中使出其屍於火中，還白上，上哭曰，果然，若是痴呆耶！”
《明史·建文皇帝本紀》雲：“上入宮，忽火發，皇后馬氏暴崩，程濟奉上變僧服遁去。燕王遂入宮因指燼中後骨以為上！”。
1、明惠宗朱允炆（1377年12月5日—？），明朝第二位皇帝，明太祖朱元璋之孫、懿文太子朱標次子，1398年6月30日－1402年7月13日在位，年號建文，故後世稱建文帝，又作朱允文。
2、洪武二十五年（1392年），其父朱標病死，朱允炆被立為皇太孫，明洪武三十一年（1398年）繼位為帝，朱允炆在位期間增強文官在國政中的作用，寬刑省獄，嚴懲宦官，同時改變其祖父朱元璋的一些弊政 ，史稱“建文新政”。
3、朱允炆于靖難之役後下落不明，時駙馬都尉梅殷在軍中，從黃彥清之議，為發喪，追諡孝愍皇帝，廟號神宗，壬午以後諡不行。至南明弘光元年（1645年）七月，以與顯皇帝廟號復，改廟號惠宗，諡號為嗣天章道誠懿淵功觀文揚武克仁篤孝讓皇帝，後世稱為明惠宗，清乾隆元年上諡號為恭閔惠皇帝，簡稱惠帝。
明朝建文帝朱允炆的下落，是千古疑案，是我國古代四大奇案之一。
主要有以下兩種說法：
1、自焚說，燕王破城，建文帝下令焚宮，攜皇后馬氏，跳入火中自焚，妃嬪侍從等，大都亦隨其蹈火而死。朱棣入宮後，清宮三日，搜查建文帝下落。宮內侍人都說建文帝已自焚，並從火堆裡扒出一具燒焦的屍體證明。
2、削髮為僧說，燕軍破城後，建文帝想一死了之。此時少監王鉞告訴他：你祖父臨死時，給你留下一個鐵箱子，讓我在你大難臨頭時交給你。我一直把它秘密收藏在奉先殿內。開啟一看，裡邊有三張度牒，就是做僧人的身份證，上面寫好了建文帝等三個人的名字。還放著三件僧衣、一把剃頭刀、白金十錠、遺書一封，書中寫明：“建文帝從鬼門出，其它人從水關御溝走，傍晚在神樂觀西房會集。”據此，建文帝似削髮為僧，繼承了朱元璋的祖業。