1、生態系統結構是指生態系統各種成分在空間上和時間上相對有序穩定狀態。包括形態和營養關係兩方面的內容。生態系統的形態結構：生態系統的生物種類、種群數量、種群的空間配置 (水平分佈、垂直分佈)、種的時間變化 (發育) 等，構成了生態系統的形態結構。如一個森林生態系統，其中動物、植物、微生物的種類，以及每一生物種類的生物數量在一定的時間內相對穩定。
2、在空間 (三維) 結構上，自上而下有明顯的層次現象，高層有喬木，中層有灌木，中下層有草本植物，地面有苔蘚、地衣類，地下有根系。生態系統的營養結構：生態系統各組成成分之間建立起來的營養關係，就構成了生態系統的營養結構，它是生態系統中能量和物質流動的基礎。
生態系統的功能和執行與它的結構有密切的關係，結構是否合理、最佳化，決定了功能的優劣。只有各組分結構協調、合理，才能發揮穩定、持續和高效的功能。生態系統的結構包括生物組分的物種結構、空間水平、垂直和多層次結構、時間結構和營養食物鏈結構。系統的整體功能並不一定等於系統中各部分要素簡單相加之和。
而一個結構合理的系統，其整體功能必定大於各部分獨立存在時的功能之和。相反，一個結構不合理的系統，其整體功能則很可能小於各部分獨立存在時的功能之和。生態系統也不例外。例如，作物生產是一個種群過程，群體產量的形成絕非各個體單獨種植時產量的簡單相加。
對於農作物種植系統而言，在氮、憐、鉀均缺乏的情況下，不論單獨使用其中的任何一種肥料,都能夠獲得作物產量的提高;但是如果採取氮、磷、鉀科學配比，綜合最佳化施肥方案，就會取得比三種肥料分別單獨使用時產生的增產量之和更高的增產量。反之，如果各種肥分搭 配不當，安排不合理，完全有可能出現整體效果小於部分之和的情況。
農業生態系統本身是一個人工的生態系統，它具有特定的結構和功能特徵。只有具有一個能保證物質迴圈和能量流轉過程暢通的良好結 構，才能產出更多的產品，更好地發揮各種有益的效能。常規現代化農業 生態系統的最大缺陷之一就是它的不穩定性，因為這種農業模式盲目地追求高投人、髙產出；大量施用化肥，導致農田土壤結構破壞和地力衰退; 不加選擇地濫用殺蟲劑、除草劑，導致有害昆蟲天敵數量的下降，使得蟲 害的發生更加頻繁，損失也更加嚴重。
生態農業正是針對這些問題而出現的一種新的替代農業經營方式，它主張合理利用生態系統內部的各種 關係維持農業生態系統的結構和功能的穩定，並強調透過調整和最佳化結 構，改善生態系統的功能，以追求長期的、穩定的和可持續的農業發展。氮素迴圈。
一、結構是由自然系統、經濟系統和社會系統所組成的。
城市中的自然系統包括城市居民賴以生存的基本物質環境，如陽光、空氣、淡水、土地、動物、植物、微生物等。經濟系統包括生產、分配、流通和消費的各個環節。社會系統涉及城市居民社會、經濟及文化活動的各個方面，主要表現為人與人之間、個人與集體之間以及集體與集體之間的各種關係。二、功能
生產功能。分別為生產，為社會提供物資和資訊產品生活功能。城市具有利用域內外環境所提供的自然資源及其他資源，生產出各類產品，即為市民提供方便的生活條件和舒適的棲息環境的能力。還原功能，城市具備的消除和緩衝自身發展帶來的不良影響能力以及在自然界發生不良變化時能儘快恢復原狀。