第一，適用物件不同。監察機關行使檢查權，適用物件是涉嫌貪汙賄賂、濫用職權、翫忽職守等職務違法和職務犯罪的公職人員。檢察機關行使偵查權，適用物件是涉嫌刑事犯罪或經濟犯罪的人員。第二，行使權利不同。監察機關行使調查權，檢察機關行使偵查權。第三，法律依據不同。監察機關調查權的法律依據是監察法；檢察機關偵查權的法律依據主要是刑事訴訟法。
法律依據
根據我國《憲法》第一百二十三條規定：中華人民共和國各級監察委員會是國家的監察機關。第一百三十四條規定：中華人民共和國人民檢察院是國家的法律監督機關。
第一，適用物件不同。監察機關行使檢查權，適用物件是涉嫌貪汙賄賂、濫用職權、翫忽職守等職務違法和職務犯罪的公職人員。檢察機關行使偵查權，適用物件是涉嫌刑事犯罪或經濟犯罪的人員。第二，行使權利不同。監察機關行使調查權，檢察機關行使偵查權。第三，法律依據不同。監察機關調查權的法律依據是監察法；檢察機關偵查權的法律依據主要是刑事訴訟法。
法律依據
根據我國《憲法》第一百二十三條規定：中華人民共和國各級監察委員會是國家的監察機關。第一百三十四條規定：中華人民共和國人民檢察院是國家的法律監督機關。
1、內涵不同：行政單位是國家機關，而機關單位是實施政府某項公益服務的部門，是社會服務組織。
2、擔負的職責不同：行政單位是負責對國家各項行政事務進行組織、管理和指揮；而機關單位是為了社會的公益目的從事教育、文化、衛生、科技等活動。
機關單位：
機關單位指國家機關，指從事國家管理和行使國家權力的機關。包括國家元首、權力機關、行政機關、審判機關、公安機關、檢察機關和軍事機關。所謂國家機關，是指國家為行使其職能而設立的各種機構是專司國家權力和國家管理職能的組織。包括中央和地方各級組織。從國家學說上講，國家機關，即國家政權機關，它包括各級權力機關、行政機關、審判機關、檢察機關和軍隊中的各級機關。在我國，中國共產黨是執政黨，憲法明文確定了共產黨在國家事務中居於領導一切的地位。因此，從廣義上講，中國共產黨的各級機關應納入國家機關的範圍。
兩者的級別及職能不同。
檢察機關是代表國家依法行使檢察權的國家機關，其主要職責是追究刑事責任，提起公訴和實施法律監督。人民檢察院是國家法律監督機關，由同級人民代表大會產生，向人民代表大會負責並報告工作。檢察院與人民法院、政府並列，稱為一府兩院。其職權主要有審查批准逮捕、決定起訴並出席法庭支援公訴的職能。中國設立最高人民檢察院、地方各級人民檢察院和軍事檢察院等專門人民檢察院。
監察機關隸屬於各級人民政府，是各級人民政府行使監察職能的機關，是管理行政監察事務的行政機關。行政監察工作應當在國務院及地方各級人民政府的領導和管理下進行。行政監察工作是國家行政管理的重要內容和必要環節，也是國家機關內部監督的重要形式。為了保證行政監察職能正確的實現，國家在政府系統設立監察機關，依法對國家行政機關、國家公務員以及國家行政機關任命的其他人員實施監察，保障社會主義建設事業的順利發展。