1、常溫儲存期限：約2～3個月，建議新鮮的洋蔥不要放入冰箱冷藏，因為它的味道非常濃郁，會讓冰箱裡其他食材染上濃濃洋蔥味!改放入竹籃或紙袋中，置於通風陰涼處為佳。因為洋蔥害怕悶熱，若用袋裝，記得袋口不要密封，另外為了保持透氣，要避免使用塑膠袋盛裝儲存。尚未處理的馬鈴薯一般也是以常溫儲存，但務必注意馬鈴薯跟洋蔥不能放在一起，因為洋蔥會吸附馬鈴薯的水氣，導致洋蔥腐壞或發芽。聰明利用!絲襪懸吊儲存法：不要的絲襪清洗乾淨、晾乾後，用來儲存洋蔥非常好用!先於絲襪尾端(腳趾處)打個小結，將洋蔥一顆一顆放入，每放一顆就打一個結，再把整串掛在通風陰涼處，要使用時再用剪刀從尾端剪一顆下來。
2.切開冷藏儲存期限：約1周，若想要冷藏已經使用一半的洋蔥，除了用保鮮膜將切面包覆後，放入冰箱冷藏之外;不妨先全部切成方便烹飪的大小，加入適量的鹽巴混合均勻，再放入保鮮容器中密封冷藏，料理時便能直接使用，非常方便。洋蔥切開後，營養素就會開始流失，氧化的速度非常快，可以使用鹽巴稍微醃漬，留住洋蔥的風味和品質。
1、挖溝貯存：大蔥收穫後，就地晾曬幾個小時，除去根上的泥土，剔除病、傷株，捆成10公斤左右的捆，放在通風良好的地方堆放6天左右，使大蔥外表水分完全陰乾。選擇背風通風處挖溝距50～70釐米。若溝底溼度小，可澆一次透水。待水全部滲下後，把蔥一捆挨一捆地擺放在貯藏溝內，然後用土埋嚴蔥白部分。在嚴寒到來之前，用草簾或玉米秸杆覆蓋即可。這樣能貯存到第二年的3月份。
2、埋藏貯存：將用上述方法經晾曬、挑選、捆捆的大蔥放在背陰的牆角或冷涼室內，底面鋪一層溼土，蔥的四周用溼土培埋至蔥葉處即可。若在室外埋藏，嚴寒來臨前可加蓋草苫防凍。
3、假植貯存：在院內或地裡挖一個淺平地坑，將立冬前收穫的大蔥，除去傷、病株，捆成小捆，假植在坑內，用土埋住蔥根的蔥白部分。埋好後用大水澆灌，增加土壤溼度，促進萌發新根，減緩蔥葉乾枯，延長保鮮時間。
1、採前噴灑抑芽劑。貯藏的洋蔥在收穫前7－10天停止澆水，在收穫前7－14天，選晴天在田間噴青鮮素（MH）0.25％水溶液，每畝用量50－75千克，並可加入200克洗衣粉，以增加粘著性。經青鮮素處理的洋蔥，可貯藏到翌年3－5月份，仍不萌芽。但由於生長點受到破壞，不能留作種用。
2、冷庫貯藏。冷庫貯藏為強迫休眠法，當洋蔥頭透過休眠即將發芽時，進入低溫的環境，使洋蔥繼續休眠以延長貯藏期。方法是在8月下旬洋蔥脫離自然休眠以前裝箱（筐）存放冷庫。入庫前先將挑選好的蔥頭預冷降溫，當洋蔥品溫接近貯藏溫度時，入冷庫貯藏，庫房溫度控制在0－3℃，相對溫度70％以下（64％左右）。溫度波動要儘量小，波動大易引起生理病變。溼度過低乾耗大，溼度過大，洋蔥表面易黴變和長白鬚。因此必須嚴格控制溫、溼度，同時要保證庫房內通風良好。