非盈利組織的企業按照所得稅稅率為25%申報企業所得稅。沒有什麼特殊的優惠政策。符合條件的非營利組織的收入為免稅收入。《企業所得稅法》規定，符合條件的非營利組織的收入為免稅收入。《實施條例》第八十五條規定，符合條件的非營利組織的收入，不包括非營利組織從事營利性活動取得的收入。所以對非營利組織的營利性活動取得的收入應徵收企業所得稅，但國務院財政、稅務主管部門另有規定的除外，這主要針對有些非營利組織將取得的營利性收入全部用於公益事業，屬於國家重點鼓勵的物件。
非盈利組織的企業按照所得稅稅率為25%申報企業所得稅。沒有什麼特殊的優惠政策。符合條件的非營利組織的收入為免稅收入。《企業所得稅法》規定，符合條件的非營利組織的收入為免稅收入。《實施條例》第八十五條規定，符合條件的非營利組織的收入，不包括非營利組織從事營利性活動取得的收入。所以對非營利組織的營利性活動取得的收入應徵收企業所得稅，但國務院財政、稅務主管部門另有規定的除外，這主要針對有些非營利組織將取得的營利性收入全部用於公益事業，屬於國家重點鼓勵的物件。
1、使用實名認證賬戶登入，輸入個人使用者名、密碼、驗證碼進行登入，進入辦稅身份選擇，選擇對應企業名稱，點選企業進入非個人進入；
2、點選申報繳稅，按期應申報，企業所得稅，填寫申報表；
3、點選網頁填寫申報，進入企業基礎資訊表頁面，進行資訊核對，點選儲存按鈕；
4、進入表單填報情況選擇頁面，納稅人勾選需要申報的表單，完成後點選右上角的下一步按鈕；
5、進入填表頁面。左側報表列表顯示納稅人需要填報的表單，右側為具體的填表頁面，填寫的申報表完成後，點選列印即可。
可以選擇網上申報，具體步驟如下（以居民企業（查賬徵收）企業所得稅季度申報為例）：
1、開啟當地稅務局官方網站，以廈門市稅務局為例，開啟官網後點擊左上角“廈門市電子稅務局”。
2、選擇“我要辦稅”，點選“稅費申報及繳納”。
3、選擇“企業所得稅申報”後，再點選“居民企業（查賬徵收）企業所得稅季報”。
4、如果符合條件，可以選擇一鍵零申報或簡易申報方式，否則點選“下一步”進行網上申報單填寫。
5、進入表單填報介面，企業可根據自身情況選擇相應表單填寫。
6、表單填寫後，點選“稽核”，系統會對所有表間關係進行校驗。
7、稽核無誤，點選“確定”即可正式申報。