電影X戰警黑鳳凰劇情設定在20世紀八九十年代，故事將聚焦鳳凰女琴・葛蕾的內在人格被釋放後黑化為暗黑鳳凰，並與X戰警開戰的故事。
X戰警將面臨他們最強大又可怕的敵人：他們的一位成員――琴・葛蕾。在一次太空救援任務中，琴被一股神秘的宇宙力量擊中險些死亡。返回家中後，這股力量令她變得無比強大的同時也極不穩定。
琴在與體內能量搏鬥期間釋放了自己無法控制也無法領會的力量。隨著不斷失去控制，琴傷害了她的至親之人。這一舉動割裂了維繫X戰警的紐帶。
現在隨著X戰警家族漸漸分崩離析，他們必須找到辦法重新團結一心，不僅為拯救琴的靈魂，更為地球的安全。因為外星勢力正意圖武器化琴體內的力量並以此統治銀河系。
最終，萬磁王和X教授拋棄成見，一場大戰眾多的X戰警都犧牲了。而且與之相對的，眾多英雄犧牲的同時，琴無動於衷。就在最後關頭，琴飛向了太空，釋放了鳳凰之力。所有外星艦隊就都被摧毀了。
《x戰警黑鳳凰》結局是黑鳳凰最後失去人的形態，化為一團火焰。黑鳳凰本命叫做琴·葛蕾，在她很小的時候，她的能量就開始顯示出很強的爆發力，六歲那年，由於自己的原因導致父母在車禍中喪生，在警察局的時候，x教授讓她到變種人學校學習，後來琴去了變種人學校。
幾年後，黑鳳凰在與x教授執行任務的過程中黑鳳凰受傷嚴重，被一股強大的能量侵襲，她自己也化為一片火海。當所有人都在悲傷的時候，她突然間的甦醒過來，讓眾人放下心來。回到地球后，琴的能量卻發生了巨大的變化，她的能量值已經高到無法用測量器測出來，這令多數人有些隱隱的擔憂。再擁有了強大的能量之後，琴，的各種心情，可中行去也比以前衝動很多，在一次醉酒之後無意間又傷害很多人，她本人也昏倒在地。
x教授企圖救她但是很難，原來是x教授，在琴腦海中植入的“防火牆”已經沒有作用，她已經突破了這道防火牆。原來琴的父親沒有死，她一直以為父母都是她害死的，她一直活在愧疚之中。然而沒想到是她竟然是被自己的父親給拋棄，x教授也在欺騙著自己，強大的能量折磨著自己，她十分的痛苦。
自己在無助的情況下不小心被德巴力人利用間接殺死了魔形女，x教授一直在勸說著琴，最終，琴看到x教授的意識被教授深深的感動並且與x教授重歸於好。最後她反攻德巴力人，釋放所有鳳凰之力殺死了女探員。然而她自己，也失去人的形態，在空中飄蕩著。所有人都回到平靜的生活，而天空中，時不時地飄過一團火焰。
電影《x戰警：黑鳳凰》於2019年6月7日於北美正式上映，2019年6月6日（中國大陸）上映，提前北美一天。
之所以改檔一部分原因是之前在舉行試映的時候發現需要進行大量的補拍，而演員大多有事務在身，一時召集起來有些困難，最終不得不延期上映。《x戰警：黑鳳凰》於2017年就已經開始拍攝，除了詹姆斯·麥卡沃伊 、邁克爾·法斯賓德以及大表姐等巨星助陣以外，勞模姐傑西卡·查斯坦也是首次作為反派出演X戰警系列。索菲·特納繼《天啟》之後，繼續出演鳳凰女這一角色。
此次故事聚焦於鳳凰女因為被自身強大的邪惡力量所吞噬，與x戰警們進行了一場殊死搏鬥。此次魔形女、x教授、萬磁王、野獸、暴風女、鐳射眼、夜行者以及快銀都將會迴歸。