個人獨資企業所得稅的計算主要如下：
1、個人獨資企業不繳納企業所得稅，而是繳納個人所得稅。《企業所得稅法》第一條第二款規定：個人獨資企業、合夥企業不適用本法。而適用《個人所稅法》，按《個人所得稅法》第二條第二款“個體工商戶生產、經營所得”專案徵收個人所得稅。
2、稅務機關對個人獨資企業個人所得稅的徵收方法有二種，一種是查賬徵收適用於會計核算比較齊全的，另一種是核定徵收。具體採用哪種徵收方法由主管稅務機關確定。
【法律依據】
《個人所得稅法》第十二條規定，納稅人取得經營所得，按年計算個人所得稅，由納稅人在月度或者季度終了後十五日內向稅務機關報送納稅申報表，並預繳稅款；在取得所得的次年三月三十一日前辦理彙算清繳。納稅人取得利息、股息、紅利所得，財產租賃所得，財產轉讓所得和偶然所得，按月或者按次計算個人所得稅，有扣繳義務人的，由扣繳義務人按月或者按次代扣代繳稅款。
個人獨資企業個人所得稅的徵收方式是：
根據《財政部國家稅務總局關於印發關於個人獨資企業和合夥企業投資者徵收個人所得稅的規定的通知》第四條規定：“個人獨資企業和合夥企業每一納稅年度的收入總額減除成本、費用以及損失後的餘額，作為投資者個人的生產經營所得，比照個人所得稅法的個體工商戶的生產經營所得’應稅專案，適用5%～35%的五級超額累進稅率，計算徵收個人所得稅。”
1、投資人數和企業財產歸屬形式不同。個人獨資企業是一個自然人進行的投資，是一個人的行為，企業財產為投資人個人所擁有；合夥企業則不是單個人的行為，它必須由2人以上的合夥人設立，聯合經營，企業財產由合夥人共同所有，並由全體合夥人共同管理和使用。
2、責任承擔不同。個人獨資企業是一個投資人投資，財產和利潤歸該投資者所有，故其對企業承擔無限責任；合夥企業的財產是由各合夥人出資所形成的，在共同經營中要求共擔風險，要求各合夥人對合夥企業的債務承擔無限連帶責任。
3、企業事務的管理方式不同。個人獨資企業的投資人對企業事務管理具有最終的決定權，投資人獨資出資，獨資經營，自行作出決策。首先以各合夥人訂立合夥協議為前提，各合夥人共同出資，共同經營，企業事務管理可以由全體合夥人共同執行，也可以由合夥人約定或者全體合夥人決定，委託一名或數名合夥人執行，但是重大事項仍然是全體合夥人共同決定。
4、投資轉讓方式不同。個人獨資企業由於不能分離，投資人要轉讓投資或撤回資本，只能透過徹底轉讓企業或者解散企業的方式；而合夥企業的財產轉讓，合夥人既可將其在合夥企業中的財產份額轉讓給其他合夥人或經全體合夥人同意轉讓給合夥人以外的第三人，也可以透過退夥的方式轉讓其財產。