勞動合同附加協議書是有法律效應的，只要是在雙方自願且符合勞動法要求前提下，簽訂的補充協議，與勞動合同享有同等法律效力。
《勞動法》第十八條規定，下列勞動合同無效：（一）違反法律、行政法規的勞動合同；（二）採取欺詐、威脅等手段訂立的勞動合同。無效的勞動合同，從訂立的時候起，就沒有法律約束力。確認勞動合同部分無效的，如果不影響其餘部分的效力，其餘部分仍然有效。勞動合同的無效，由勞動爭議仲裁委員會或者人民法院確認。
勞動合同附加協議書是有法律效應的，只要是在雙方自願且符合勞動法要求前提下，簽訂的補充協議，與勞動合同享有同等法律效力。
《勞動法》第十八條規定，下列勞動合同無效：（一）違反法律、行政法規的勞動合同；（二）採取欺詐、威脅等手段訂立的勞動合同。無效的勞動合同，從訂立的時候起，就沒有法律約束力。確認勞動合同部分無效的，如果不影響其餘部分的效力，其餘部分仍然有效。勞動合同的無效，由勞動爭議仲裁委員會或者人民法院確認。
勞動合同的效力與用什麼筆簽訂是沒有關係的，勞動合同由用人單位與勞動者協商一致，並經用人單位與勞動者在勞動合同文字上簽字或者蓋章生效。
【法律依據】
《勞動合同法》第十六條規定，勞動合同由用人單位與勞動者協商一致，並經用人單位與勞動者在勞動合同文字上簽字或者蓋章生效。勞動合同文字由用人單位和勞動者各執一份。
合同補充協議作為合同的一部分，與合同具有同等法律效力。合同是當事人或當事雙方之間設立、變更、終止民事關係的協議。依法成立的合同，受法律保護。
【法律依據】
《中華人民共和國合同法》第三十二條，當事人採用合同書形式訂立合同的，自雙方當事人簽字或者蓋章時合同成立。
第六十一條，合同生效後，當事人就質量、價款或者報酬、履行地點等內容沒有約定或者約定不明確的，可以協議補充；不能達成補充協議的，按照合同有關條款或者交易習慣確定。