農村徵地補償糾紛的主要原因有：
1、農村土地徵收補償費用的性質和歸屬法律規定不明確；
2、國家農村土地徵收補償標準不合理；
3、補償程式不完善，司法救濟難到位。
【法律依據】
《國有土地上房屋徵收與補償條例》第二十六條，房屋徵收部門與被徵收人在徵收補償方案確定的簽約期限內達不成補償協議，或者被徵收房屋所有權人不明確的，由房屋徵收部門報請作出房屋徵收決定的市、縣級人民政府依照本條例的規定，按照徵收補償方案作出補償決定，並在房屋徵收範圍內予以公告。
農村徵地補償糾紛的主要原因有：
1、農村土地徵收補償費用的性質和歸屬法律規定不明確；
2、國家農村土地徵收補償標準不合理；
3、補償程式不完善，司法救濟難到位。
【法律依據】
《國有土地上房屋徵收與補償條例》第二十六條，房屋徵收部門與被徵收人在徵收補償方案確定的簽約期限內達不成補償協議，或者被徵收房屋所有權人不明確的，由房屋徵收部門報請作出房屋徵收決定的市、縣級人民政府依照本條例的規定，按照徵收補償方案作出補償決定，並在房屋徵收範圍內予以公告。
可以透過以下方式解決：
主要有行政訴訟、行政複議、行政複議裁決、民事訴訟、徵地補償協調、裁決等方式。
【法律依據】
《行政訴訟法》第二條規定，公民、法人或者其他組織認為行政機關和行政機關工作人員的行政行為侵犯其合法權益，有權依照本法向人民法院提起訴訟。
《民事訴訟法》第三條規定，人民法院受理公民之間、法人之間、其他組織之間以及他們相互之間因財產關係和人身關係提起的民事訴訟，適用本法的規定。
房屋拆遷補償的方式：
一、貨幣補償
貨幣補償是透過不同的法定依據由專業的評估機構對被拆遷房屋進行專業的估價，生成有據可循的多遠組成的補償金額。
二、產權置換
產權置換也被稱作產權調換，根據評估方法不同，有兩種置換方式。價值標準產權置換指的是依照法定程式，透過對被拆遷人房屋的產權價值進行評估，之後再以新建房屋的產權予以價值的等價置換。面積標準產權置換指的是以房屋建築面積為基礎，在應安置面積內不結算差價的異地產權房屋調換。
三、結合型補償
顧名思義，這種補償方式就是指既給貨幣補償又給產權置換。
《國有土地上房屋徵收與補償條例》第二十一條規定，被徵收人可以選擇貨幣補償，也可以選擇房屋產權調換。被徵收人選擇房屋產權調換的，市、縣級人民政府應當提供用於產權調換的房屋，並與被徵收人計算、結清被徵收房屋價值與用於產權調換房屋價值的差價。因舊城區改建徵收個人住宅，被徵收人選擇在改建地段進行房屋產權調換的，作出房屋徵收決定的市、縣級人民政府應當提供改建地段或者就近地段的房屋。