名偵探柯南與黑衣組織有關的集數（不完全統計）有以下：001《雲霄飛車殺人案件》、002《董事長千金誘拐事件》、005《 新幹線大爆破事件》、013《奇怪的尋親殺人事件》、043《江戶川柯南誘拐事件》、048——049《外交官殺人事件》、128《黑暗組織10億搶劫事件》、129《來自黑暗組織的女子大學。
名偵探柯南與黑衣組織有關的集數（不完全統計）有以下：001《雲霄飛車殺人案件》、002《董事長千金誘拐事件》、005《 新幹線大爆破事件》、013《奇怪的尋親殺人事件》、043《江戶川柯南誘拐事件》、048——049《外交官殺人事件》、128《黑暗組織10億搶劫事件》、129《來自黑暗組織的女子大學。
名偵探柯南與黑衣組織有關的集數（不完全統計）有以下：001《雲霄飛車殺人案件》、002《董事長千金誘拐事件》、005《新幹線大爆破事件》、013《奇怪的尋親殺人事件》、043《江戶川柯南誘拐事件》、048——049《外交官殺人事件》、128《黑暗組織10億搶劫事件》、129《來自黑暗組織的女子大學。
名偵探柯南與黑衣組織有關的集數（不完全統計）有以下：001《雲霄飛車殺人案件》、002《董事長千金誘拐事件》、005《 新幹線大爆破事件》、013《奇怪的尋親殺人事件》、043《江戶川柯南誘拐事件》、048——049《外交官殺人事件》、128《黑暗組織10億搶劫事件》、129《來自黑暗組織的女子大學教授殺人事件》。
176到178《與黑暗組織的再會》、188到189話、190到193《危命的復活》、286到288《工藤新一紐約事件》、309到311《與黑暗組織的接觸》、462到465《黑暗組織的影子》、580《緊迫黑色的時限》、671 到674《偵探們的夜想曲》、699到700《逼近灰原秘密的黑影》、701到704《漆黑的特快列車》、703到704《漆黑的特快列車》等。
《名偵探柯南》中黑衣組織是一個籠罩在神秘色彩中的跨國犯罪組織，江戶川柯南稱其為“烏鴉軍團”。
黑衣組織從劇集的第一集中就出現了，該劇集的主角工藤新一和青梅竹馬小蘭一起去遊樂園約會，無意間撞見了黑衣組織的交易，後來被下藥導致身體縮小。
為了避免被黑衣組織再次傷害，柯南決定隱名埋姓住在毛利蘭的家中調查黑衣組織的真相，這也是整部劇情的一個導火索。