一般認為16世紀西班牙帝國消滅了瑪雅文明。
瑪雅文明：是現代分佈於現今墨西哥東南部、瓜地馬拉、宏都拉斯、薩爾瓦多和貝里斯國家的叢林文明。雖然處於新石器時代，卻在天文學、數學、農業、藝術及文字等方面都有極高成就。瑪雅文明與印加帝國及阿茲特克帝國並列為美洲三大文明。
依據中美洲編年，瑪雅歷史分成前古典期、古典期及後古典期。前古典期也稱形成期，曆法及文字的發明、紀念碑的設立及建築的興建均在此時期；古典期是全盛期，此時期文字的使用、紀念碑的設立、建築的興建及藝術的發揮均在此時期達於極盛；後古典期，此時期北部興起奇琴·伊察及烏斯馬爾等城邦興起，文化也逐漸式微(衰弱)。瑪雅從來不像中國、埃及等文明擁有一個統一的強大帝國，全盛期的瑪雅地區分成數以百計的城邦，然而瑪雅各邦在語言、文字、宗教信仰及習俗傳統上卻屬於同一個文化圈。16世紀時，瑪雅文化的傳承者阿茲特克帝國被西班牙帝國消滅。
關於瑪雅文明消失之謎，科學家們提出了不同的說法，有人認為是自然災害的爆發，有人認為是瘟疫的橫行，當然以上兩種推測根據科學家的考察認為是不可能的，還有人認為是外族的入侵，因為有人提出，瑪雅人並不是一個愛好和平的民族，他們為了爭權奪利而好鬥善戰，發動戰爭，正是因為戰爭的無休無止，才造就了一個民族的滅亡，當然這也僅僅是推測。更有人認為，瑪雅人的消失與外星人的星球大轉移有關，正是因為如此，才導致了瑪雅人的消失。
“如果不能改變風的方向，就要想辦法調整風帆；如果不能改變事情的結果，就需要改變自己的心態。微笑著面對生活，即使一文不名也能睡得香甜；微笑著面對人生，即使在黑暗中你也能看到希望的曙光。”接下來，來看看民族文化為我們解答瑪雅文化消失之謎。
消失原因猜測段時間之後突然走向衰落，讓人百思不得其解。公元830年，科潘城浩大的工程突然停工；公元835年，帕倫克的金字塔神廟停止施工；公元889年，迪卡爾正在建設中的寺廟群工程中斷；公元909年，瑪雅人最後一個城堡，停下已修過半的石柱。散居在叢林中的瑪雅人拋棄原來的家園，集體向北遷移。從此以後，瑪雅文化消失於叢林之中，於是人們作了一些猜測。
隨外星人而去
在布蘭科“銘文神殿”中，曾發現一個皇家墳墓。中間停放一具巨大的石棺，裡面是一位瑪雅國王的遺骨。一般認為是布蘭科一位極受尊敬的國王，名為太陽陛下帕卡爾。石棺用一塊巨大的木蘭花色石灰石做成，重約5噸，面積超過7平方米。
石棺蓋的雕刻複雜，刻畫一個蜷曲的W形狀的瑪雅人形，位於中心懸浮，周圍環繞奇怪的圖案。瑞士作家馮·丹尼肯的名著《神之戰車》提到，在棺蓋中心蜷著身子的人實際是一個宇航員，正在控制起飛的飛船。
有人甚至推測瑪雅人突然消失的原因是隨外星人的宇宙飛船一同離去。瑪雅人對天文如此瞭解，創造奇蹟之後神秘消失，也許是外星人的後裔，被先進的星球“祖先”接走。
沉入大海
據有關資料，有學者認為，在大西洋中曾有一個大西洲，經濟繁榮，文化發達，在10000多年前一夜之間沉入大海。而大西洲的位置離猶卡坦半島很近。德國科學家莫克認為，瑪雅人在公元前8499年6月5日開始其新紀元。在瑪雅人中流傳“世界由5個太陽主宰，一個太陽代表一個紀元”。
所以若以上材料真實可靠，也許瑪雅人是倖存的大西洲人和美洲當地人的後代，深知祖先的毀滅，認為在公元后又一個紀元的某一天將滅亡，所以集體向北遷移，並在之後集體跳入大西洋，逃避世界的滅亡。這一說有待證實。
內部暴亂
據考古研究，在阿茲特克人到達陶帝華康城（Tonuhuacan）時，這座古城已經荒廢。考古學家認為那裡發生推翻僧侶神權統治的暴動，其現存的神像都被砍去腦袋、祭祀神廟遭到搗毀等事實暗示暴動。據此推測，瑪雅文化消失的原因正是如此。大量祭祀、壓迫使人民起來反抗，於是瑪雅統治世界發生大暴亂，導致瑪雅文化滅亡。
祭祀殺人
古瑪雅人與阿茲特克人有許多相似之處，認為太陽將走向毀滅，自己的行為能延續太陽存在——必須透過自我犧牲保持太陽的光芒四射，阻止其滅亡，導致以人心和鮮血獻祭太陽。瑪雅人以祭祀為榮，為此死亡的人越來越多。
據說16世紀西班牙人曾在祭祀頭顱架上發現136000具頭骨！為了慶祝特偌提蘭大金字塔落成，在四天的祭祀中，奴隸主竟然殺死36萬人！用於祭祀的大多是族中身體健康的人。頻繁的祭祀，使被殺的人不斷增多。瑪雅人口大量減少，是造成瑪雅文化消失的原因。