具體步驟如下：
1、編寫建賬表。將合作社現有的有形資產、債權債務、相關權益等，按合作社會計制度要求，分門別類地歸集整理，按順序科學地填入建賬表。
2、填寫賬簿啟用表。在賬簿的封面寫明本賬簿名稱、農民合作社名稱和啟用年度。賬簿的扉頁都印有“賬簿啟用表”，農民合作社財會人員應根據內容在輔導員的指導下如實填寫。
3、編排賬戶目錄。賬簿啟用表的後頁都印有賬簿目錄，編排賬戶目錄的作用是為了便於記賬和看賬時方便查詢賬戶。
4、開設賬戶。按照賬戶目錄的順序，在各該賬頁的上方填寫賬戶名稱，每個賬戶佔用的賬頁數必須與賬戶目錄相符。
農民專業合作社承諾書在工商行政管理部門列印。
農民專業合作社的設立人申請設立登記的，應當向登記機關提交的檔案包括：登記申請書；全體設立人簽名、蓋章的設立大會紀要；全體設立人簽名、蓋章的章程；法定代表人、理事的任職檔案及身份證明；出資成員簽名、蓋章的出資清單；住所使用證明；法律、行政法規規定的其他檔案。農民專業合作社向登記機關提交的出資清單，只要有出資成員簽名、蓋章即可，無需其他機構的驗資證明。
農民專業合作社的登記工作，在登記機關受理之後的20日內必須辦理完畢。20個工作日的期限規定，也適用於變更登記和登出登記等。地方工商管理部門登記機關辦理農民專業合作社登記時，不收取費用。
1、農民專業合作社受傷人員不能按照工傷保險條例獲得賠償。只能按照合作社的規章制度執行，是否有明確工傷後處理的有關規定。
2、農民專業合作社不是社會團體。《社會團體登記管理條例》規定，成立社會團體必須提交業務主管部門的批准檔案。業務主管部門是指縣級以上各級人民政府有關部門及其授權的組織。社會團體實際上附屬在業務主管部門之下。中國的社會團體是社會組織的一種。
3、農民專業合作社也不是民辦非企業單位。國務院頒佈法《民辦非企業單位登記管理暫行條例》，將民辦非企業單位界定為:企業事業單位、社會團體和其他社會力量以及公民個人利用非國有資產舉辦的，從事非營利性社會服務活動的社會組織。
4、農民專業合作社是互助性經濟組織，不在《工傷保險條例》規定的用人單位範圍內，無論從政策依據，還是工傷保險經辦機構的實際操作，農民專業合作社都無法辦理工傷保險登記和繳費。即農民專業合作社內工作人員受傷，因用工主體不適合，無法享受工傷保險待遇。