湖水色彩的起因，由於水是富含鈣離子，水流緩慢，所以經過長年的沉積，水中漸漸生成不同形狀的沉積， 湖水對太陽光的散射、反射和吸收，太陽光或自然光是由不同波長的單色光組合而成的複色光，在光譜中，由紅光至紫光，波長逐漸減小，九寨溝的湖水呈現豔麗的藍綠色，說明湖水中短波長的散射遠大於長波長，這就是瑞利散射效應，瑞利散射效應在九寨溝的湖水中之所以尤為突出，主要是因溝內植被鬱閉度高、水迴圈條件較暢通以及石灰華對懸移質的固定作用，從而使水中懸浮物、有機物、浮游生物極少，湖水的潔淨度和透明度極高。
湖水色彩的起因，由於水是富含鈣離子，水流緩慢，所以經過長年的沉積，水中漸漸生成不同形狀的沉積， 湖水對太陽光的散射、反射和吸收，太陽光或自然光是由不同波長的單色光組合而成的複色光，在光譜中，由紅光至紫光，波長逐漸減小，九寨溝的湖水呈現豔麗的藍綠色，說明湖水中短波長的散射遠大於長波長，這就是瑞利散射效應，瑞利散射效應在九寨溝的湖水中之所以尤為突出，主要是因溝內植被鬱閉度高、水迴圈條件較暢通以及石灰華對懸移質的固定作用，從而使水中懸浮物、有機物、浮游生物極少，湖水的潔淨度和透明度極高。
五彩池位於九寨溝Y字型三條溝的則查窪溝南段，長海的北邊，以秀美多彩純淨通透而聞名，是九寨溝最小也是最豔麗的池子。五彩池是九寨溝湖泊中的精粹，上半部呈碧藍色，下半部則呈橙紅色，左邊呈天藍色，右邊則呈橄欖綠色。湖裡生長著水綿、輪藻、小蕨等水生植物群落，還生長著蘆葦、節節草、水燈芯等草本植物。這些水生群落所含葉綠素深淺不同，在富含碳酸鈣質的湖水裡，能呈現出不同的顏色。冬季四周冰天雪地，而這個五彩斑斕的小海子卻不凍冰，甚為奇絕。
九寨溝是喀斯特溶蝕作用發育形成的。
1、 喀斯特原為歐洲巴爾幹半島的一個地名，那裡是石灰岩分佈區，因石灰岩的溶蝕和侵蝕形成各種奇特的地形。後來，科學家們便使用喀斯特一詞來稱呼因石灰岩的化學溶解而引起的一系列地址作用和地貌現象。華南亞熱帶地區，人們在地表看到的主要是石灰岩被溶蝕的峰林、峰叢景觀，只在氣溫較低的地下溶洞中才能見到再沉積的鐘乳石等。
2、九寨溝，地表常年氣溫遠低於華南亞熱帶區， 地表的溶蝕景觀不甚突出，除了上游地表有較多溶溝、石芽外，溶蝕主要在地下進行。