南京公有住房買賣繳稅流程為：
1、公有住房承租人在落實受買人後，先按當時的出售公有住房政策與公有住房的所有權人或受託人簽訂《公有住房買賣合同》。可售公有住房承租人即可憑《公有住房買賣合同》與買受人簽訂《公有住房出售合同》。
2、可售公有住房上市成交雙方當事人在《出售合同》簽訂後的三十天內，應持有關資料，向房屋所在地區、縣房地產交易中心辦理交易過戶稽核手續。
3、原可售公有住房承租人在收到經區、縣房地產交易中心稽核的《市已購公有住房上市交易過戶稽核表》後。持有關資料向公有住房所有權人或受託人辦理購房手續，並交納公有住房購房款項和首期房屋維修基金。
4、可售公有住房上市出售買賣雙方當事人憑《過戶稽核表》及有關資料按規定分別向財稅部門和交易中心交清全部稅費或保證金後三天內，憑稅費或保證金交款憑證及有關資料向區、縣房地產登記處辦理變更登記手續，申領房地產權證。
已購公有住房買賣繳稅的費用為：
1、營業稅，根據財政部、國家稅務總局《關於調整房地產市場若干稅收政策的通知》精神，對個人購買並居住超過一年的普通住宅，銷售時免徵營業稅；個人購買並居住不足一年的普通住宅，銷售時營業稅按銷售價減去購入原價後的差額計徵。
2、城市維護建設稅，根據納稅義務所在地不同，可按照7%、5%、1%三檔差別比例稅率計算稅金。
3、教育費（地方）附加，個人在繳納營業稅的同時，以繳納的營業稅額為計稅依據，徵收率分別為3%、1%。
4、印花稅，根據《中華人民共和國印花稅暫行條例》的規定，個人產權的買賣所立的書據，按書居所載金額的萬分之五貼印花稅。
5、土地增值稅，就其轉讓房地產所取得的增值額徵收土地增值稅，分別按30%、40%、50%、60%四級超率累進稅率徵收土地增值稅。
6、個人所得稅，轉讓財產取得的收入總額，扣除財產原值和合理費用後的餘額為應納稅所得稅額，按應納稅所得額的20%計算繳納個人所得稅。
已購公有住房買賣退稅流程是：
1、準備相關材料。包括已出售公有住房的房產證、出售公有住房的買賣合同（已在建委檔案部門加蓋“已過戶”印章）、出售公有住房時取得的“稅務機關代開統一發票”、新購二手房的買賣合同、新購房屋的房產證（已貼印花稅）。如已抵押，則需提供抵押合同（影印抵押合同主要內容即可）及產權證、新購二手房時取得的稅務機關代開統一發票、新購房屋繳納的契稅票、購房人及出售公有住房合法身份證明（需正反面影印）、與契稅納稅人名稱一致的銀行實名制、活期、個人結算戶存摺（存款餘額不少於50元）。
2、網上預約。不同城區辦理退稅業務流程或有不同。以朝陽為例，辦理退稅需首先進行網上預約，預約成功後才可以攜帶資料到朝陽地稅部門進行退稅。需要進入當地稅務局官網，選擇網上預約後，）選擇“減免退稅分類”與“賣公房買新房退稅”，並選擇預約日期即可預約完成。