對於孫武是怎麼死的，歷史上主要有兩種說法，一是孫武辭官隱退後在吳國終老病逝，另一種說法孫武乃是被夫差殺死的。
第一種說法，孫武辭官隱退後在吳國終老病逝是歷史上的主流觀點，孫武見夫差不仁，於是隱退於吳國，專心著書研究學問，最後於公元前470年病逝。
第二種說法出自《漢書·刑法志》，有文字記載“孫、吳、商、白之徒，皆身誅戮於前，而功滅亡於後”，這是說孫武、商鞅等人皆是功業完成後，失去了利用價值，再加上遭受猜忌所以被誅殺身死，因此可能是伍子胥被夫差殺死後，孫武也被牽連受害。不過，《史記》中沒有相關孫武被誅殺的記載，此說法僅出自《漢書》，並且其沒有更進一步的解釋和闡述。
史書中對孫武的後期生活並無記載，不過確信的是，孫武明白鳥盡弓藏的道理，於是退隱江湖，並以其戰爭經驗改良孫子兵法，使之成為一代鉅著。 孫武深知吳王為人，遂邀伍子胥一同退隱，伍子胥並未答應，直到死前一刻才後悔沒同孫武離開。 孫武之子孫明被吳王封為富春侯，是為富春孫氏之始。
孫武已經三天沒有好好吃一頓飯了，他陷入了極度失意和苦悶中。夜深人寂，外邊漆黑一團，整個姑蘇 城也像死了一般。掐指一算，從齊國逃到吳國來，差不多有三十多個年頭。如今真的老了，臉上添了許多皺紋，鬢邊也透出縷縷白髮。與自己朝夕相伴、共同輔佐吳 王的伍子胥竟然被賜死。孫武知道，在那個自負倨傲的吳王夫差眼裡，他也是一個可有可無的人了。
打仗、打仗，孫武這一輩子就像是為打仗而生。可那個年代就是個打仗的年代呀！他的爺爺、父親都是齊國謀略出眾、能征善戰的將領。孩子出世時，爺爺說：“當今正值亂世，人心思定，若此兒能以武安邦定國，算是實現我最大的心願了。就叫孫武吧！”
孫武翻出了他初到吳國隱居羅浮山時所撰寫的兵法十三篇，那年他才二十歲出頭。望著這些簡牘， 眼前又浮現了許多往事：少時父親送給他姜太公寫的《六韜軍法》，蒙山深處鬼谷子老師的點撥教誨，爺爺求齊景公允許他到秘府（國家圖書館）去查閱軍事記錄， 還有他實地到古戰略去考察形勢。沒有這些積累他怎麼能寫出自己的戰之略、兵之法呢？
正是在羅浮山，他相識了從楚國逃到吳國的伍子胥。在他的山間居所，在屋前清澈的小溪旁，他們一見如故，相談甚歡。相近的命運、共同的理想，使他們成為莫逆之交。
遠處傳來幾聲狗吠，打破了夜的寧靜，孫武的內心波瀾起伏。
當年與吳王闔閭及伍子胥談兵論道是何等暢快。誰承想第一次訓練軍隊，竟是一幫宮女，還殺了大王兩個心愛的美人。第一次用兵是在養城打敗楚軍，還有按照我的謀略把楚軍牽來牽去，在柏舉大敗楚軍，還有在會稽山大敗越軍……。想到這些歲月，孫武的臉上露出一絲苦澀的笑。
打仗、打仗，打了大半輩子的仗，到底為了誰？終究有什麼意義呢？吳國眼看就要被越國滅亡。不 定哪一天，吳王也會賜我一把自刎的劍吧！不如儘快離開吳國，回到生我養我的齊國，去那裡了卻殘生。拿定了主意，孫武開始收拾他的衣物，還有那一卷兵書，都 裝進行囊，乘天還沒亮，匆匆出城，離開了吳國。
兵法，用兵之法，本來就是你可以用來殺我，我也可以用來殺你的東西。春秋之後，中國進入了兵爭更加激烈的戰國，孫子的後世有個叫孫臏的，若不是因了《孫子兵法》這冊書，還不至於丟了兩塊膝蓋骨。
歷史不會沒有戰爭，《孫子兵法》這個兵家的智庫，也名聲日噪，廣為流傳。人們無法評價孫武的事功，但卻崇敬他的精論。據說拿破崙在滑鐵盧失敗後才讀到這部書，他感嘆說：我要早有這部兵書相助，也不致遭此慘敗。
孫武留給我們的全部財富，就只有兩個字——謀略。