社會保險行政部門和衛生行政部門應當建立異地就醫醫療費用結算制度，方便參保人員享受基本醫療保險待遇。因此異地生孩子農村合作醫療是需要按照以下方式進行報銷的：1、在辦理出院時，需要讓醫院把所有報銷的材料出具給病人；2、報銷人需要拿著醫院出具的相關材料，去當地的社會保險經辦機構申請異地報銷；3、社會保險經辦機構會對材料進行審查；4、認為符合報銷情形的，給予報銷。
法律依據：《中華人民共和國社會保險法》第二十九條參保人員醫療費用中應當由基本醫療保險基金支付的部分，由社會保險經辦機構與醫療機構、藥品經營單位直接結算。社會保險行政部門和衛生行政部門應當建立異地就醫醫療費用結算制度，方便參保人員享受基本醫療保險待遇。
1、門診報銷比例
（1）村衛生室及村中心衛生室就診報銷60%，每次就診處方藥費限額10元，衛生院醫生臨時補液處方藥費限額50元。
（2）鎮衛生院就診報銷40%，每次就診各項檢查費及手術費限額50元，處方藥費限額100元。
（3）二級醫院就診報銷30%，每次就診各項檢查費及手術費限額50元，處方藥費限額200元。
（4）三級醫院就診報銷20%，每次就診各項檢查費及手術費限額50元，處方藥費限額200元。
（5）中藥發票附上處方每貼限額1元。
（6）鎮級合作醫療門診補償年限額5000元。
2、住院報銷比例
（1）報銷範圍：A、藥費：輔助檢查：心腦電圖、X光透視、拍片、化驗、理療、針灸、CT、核磁共振等各項檢查費限額200元；手術費（參照國家標準，超過1000元的按1000元報銷）。B、60週歲以上老人在興塔鎮衛生院住院，治療費和護理費每天補償10元，限額200元。
（2）報銷比例：鎮衛生院報銷60%；二級醫院報銷40%；三級醫院報銷30%。
3、大病報銷比例
（1）鎮風險基金補償：凡參加合作醫療的住院病人一次性或全年累計應報醫療費超過5000元以上分段補償，即5001-10000元補償65%，10001-18000元補償70%。鎮級合作醫療住院及尿毒症門診血透、腫瘤門診放療和化療補償年限額1.1萬元。
1、鄉(鎮)衛生院醫療費報銷比例.
（1）300元以下的，報銷30%;
（2）300元(不含)以上2000元以下的，報銷70%;
（3）2000元(不含)以上的，報銷50%。
2、縣級定點醫療機構醫療費報銷比例。
（1）500元以下的，報銷25%;
（2）500元(不含)以上10000元以下的，報銷65%;
（3）10000元(不含)以上的，報銷50%。
3、二級醫院醫療費報銷比例。
（1）500元以下的，報銷25%;
（2）500元(不含)以上10000元以下的，報銷55%;
（3）10000元(不含)以上的，報銷50%。
4、三級醫院醫療費報銷比例。
（1）1000元以下的，報銷20%;
（2）1000元(不含)以上10000元以下的，報銷45%;
（3）10000元以上(不含)的，報銷40%。