商業用房房產證是不能分開辦理的，但如果是兩套房的話，符合條件可以分開辦理商業用房的房產證。辦理商業房產證需要建築專案有土地證，建設許可證，施工許可證，規劃許可證。建設的房屋符合建築規範，無質量問題，且相關費用全額繳納。住宅小區的房子，一般是登記住宅用途。如按商業申報，需要你的土地證登記是商業用地，規劃設計是商業用房才可以。房產證是購房者透過交易，取得房屋的合法所有權，可依法對所購房屋行使佔有、使用、收益和處分的權利的證件。另外，商業房產證和居住房產證沒有本質的區別和特別的限制，只是在規劃（土地）用途一欄有區別，別商業房寫的是商業，住宅房寫的是住宅。商業房產證在辦理和轉讓過程中的稅費相對較高，具體高多少要看當地政策。還有一個比較大的區別，就是商業房產的土地使用年限較普通住宅有較大的差距。原則上，普通住宅是70年，商用住宅使用年限是40年。
商業用地房產證可以提取公積金，說明如下：
房產必須要有房產證方可提取公積金，而且房產證上還必須要是本人的名字。另外若是建造、翻建、大修自住住房也可以攜帶相關證件也可以提取公積金。如果光是買了地，是不能辦理公積金的。如果這塊地不是用來建造個人自住住房，也將無法辦理。
相關說明：
住房公積金提取稽核，是指各地公積金管理中心(分中心、管理部）或者中心委託的各個公積金提取業務經辦銀行網點，根據住房公積金的相關政策、規定和操作規範，對提取申請人的提取資格和提取行為真實性進行檢驗的方式，目的在於確保住房公積金資金的安全性和住房公積金的專款專用。
住房公積金是單位及其在職職工繳存的長期住房儲金，是住房分配貨幣化、社會化和法制化的主要形式。住房公積金制度是國家法律規定的重要的住房社會保障制度，具有強制性、互助性、保障性。
一般來說，商業用地房產證是不可以寫酒店用房的。房地產按照用途首先可以分為居住房地產和非居住房地產兩大類。非居住房地產又可分為商業房地產、辦公房地產、工業房地產、農業房地產和特殊用途房地產。房產證上的規劃用途是根據土地性質來的，如果該土地規劃是住宅用地，那房產證上面規劃用途就是住宅，如果是商業用地，房產證上面就是商業。房地產權初始登記房屋用途，應以城市規劃管理部門核發的建設工程規劃驗收證明檔案所確定的建築物各部位具體用途為依據。申請房屋用途變更登記的，須持城市規劃部門同意改變房屋用途的書面意見到相關單位進行變更。為便於房地產權證使用者瞭解證內有關房屋由城市規劃部門認定的具體用途，可在附記欄註記非居住用房的規劃用途，如註記“城市規劃房屋用途：商場（或辦公用房、廠房等）“。