自產香菇免徵增值稅，外購再銷售則需要交納增值稅。
財政部國家稅務總局關於印發《農業產品徵稅範圍註釋》的通知（財稅字〔1995〕52號）：
一、《中華人民共和國增值稅暫行條例》第十六條所列免稅專案的第一項所稱的“農業生產者銷售的自產農業產品”，是指直接從事植物的種植、收割和動物的飼養、捕撈的單位和個人銷售的註釋所列的自產農業產品；對上述單位和個人銷售的外購的農業產品，以及單位和個人外購農業產品生產、加工後銷售的仍然屬於註釋所列的農業產品，不屬於免稅的範圍，應當按照規定稅率徵收增值稅。
自產香菇免徵增值稅，外購再銷售則需要交納增值稅。
財政部國家稅務總局關於印發《農業產品徵稅範圍註釋》的通知（財稅字〔1995〕52號）：
一、《中華人民共和國增值稅暫行條例》第十六條所列免稅專案的第一項所稱的“農業生產者銷售的自產農業產品”，是指直接從事植物的種植、收割和動物的飼養、捕撈的單位和個人銷售的註釋所列的自產農業產品；對上述單位和個人銷售的外購的農業產品，以及單位和個人外購農業產品生產、加工後銷售的仍然屬於註釋所列的農業產品，不屬於免稅的範圍，應當按照規定稅率徵收增值稅。
從2012年1月1日起，蔬菜流通環節都免交增值稅。
銷售蔬菜並不是全部免稅，免稅蔬菜存在兩個範圍。
範圍1：農業生產者銷售的自產農業產品免徵增值稅。
範圍2：“農業生產者銷售的自產農業產品”是指直接從事植物的種植、收割和動物的飼料、捕撈的單位和個人銷售的註釋所列的自產農業產品；對上述單位和個人銷售的外購的農業產品，以及單位和個人外購農業產品生產、加工後銷售的仍然屬於稅法註釋所列的農業產品，不屬於免稅的範圍，應當按照規定稅率徵收增值稅。
香菇是免稅的，我國對於農產品是有免稅政策的，從事農產品批發零售的納稅人銷售的蔬菜和肉蛋禽（只針對豬牛羊）免徵增值稅，且應當向國稅局做免稅備案。香菇作為農產品，國家對其出口退稅也是有明確規定的。